ОГЛАВЛЕНИЕ
ОГЛАВЛЕНИЕ…………………………………………………………………………… 2
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ……………………………………………………...………. 3
ВВЕДЕНИЕ………………………………………………………………………………. 5
Глава 1. Получение и применение разветвлённых олигонуклеотидных конъюгатов
(обзор литературы)
1.1. Разветвляющие реагенты для использования в твердофазном автоматическом
олигонуклеотидном синтезе ………………………………………………………….
1.2 Синтез олигонуклеотидов, содержащих разветвлённую N-ацетил
галактозаминовую модификацию ……………………………………………………
1.3 Синтез разветвлённых олигонуклеотидных конъюгатов с использованием
биоортогональных реакций …………………………………………………………..
1.4 Разветвлённые конъюгаты аптамеров ……………………….……………………..
10
18
22
29
Глава 2. Разработка подходов к синтезу разветвлённых олигонуклеотидных
конъюгатов (результаты и обсуждение)
2.1. Разветвляющие реагенты на основе пентаэритрита …………………….…….….
2.2 Синтез разветвлённых олигонуклеотид-олигонуклеотидных конъюгатов………..
2.3 Гомогенные олигонуклеотидные конъюгаты из диазида и сборка простой
наноструктуры на их основе ………………………………………………………….
2.4. Наномономеры для сборки динамических ДНК-наноструктур …………………….
2.5. Олигонуклеотидные конъюгаты, содержащие разветвлённые кластеры N
ацетилгалактозамина ………………………………………………………….……..
2.6. Синтез равзветвлённых конъюгатов EGFR-специфического аптамера,
содержащих ферментативно–отщепляемый ММАЕ ………………………………
32
33
38
46
55
59
Глава 3. ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ (материалы и методы)
3.1. Общие методы …………………….………………………………………………...
3.2. Синтез низкомолекулярных соединений ………………………………….……….
3.3. Синтез разветвлённых олигонуклеотидных конъюгатов из полиазидов …….….
3.4. Конъюгация красителей Cy3 и Cy5 …………..…………………………….……….
3.5. Синтез V-образных олигонуклеотидных конъюгатов .…………..……….……….
3.6. Дискретные ДНК-наноструктуры из гомо V-образных блоков ……....….……….
3.7. Синтез несимметричных V-образных блоков …………..………...……….……….
3.8. Получение наномономеров NM1 и NM2 …………….…….……………….……….
3.9. Молекулярное моделирование олигонуклеотидных конъюгатов ………………….
3.10. Атомно-силовая микроскопия …………………………………………….…….…..
3.11. Синтез олигонуклеотидных конъюгатов с кластерами GalNAc …….…….……..
3.12. Синтез конъюгатов аптамеров с MMAE …………………………….…….………
66
67
73
74
74
76
77
77
78
78
79
79
ВЫВОДЫ ………………………………………………………………………………....... 81
БЛАГОДАРНОСТИ ………………………………………………………………………... 82
ЛИТЕРАТУРА …………………………………………………………………………....... 83
