ВВЕДЕНИЕ ...................................................................................................................... 4
ГЛАВА 1. ХАРАКТЕРИСТИКА ЭПИДЕМИЧЕСКОГО ПРОЦЕССА
ТУБЕРКУЛЕЗА И COVID-19 (ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ) .......................................... 12
1.1 Заболеваемость, распространенность, смертность от туберкулеза ............. 12
1.2 Генетическая гетерогенность M. tuberculosis ................................................ 13
1.3 Множественная лекарственная устойчивость M. tuberculosis ..................... 15
1.4 ВИЧ-инфекция в сочетании с туберкулёзом ................................................. 17
1.5 COVID-19 .......................................................................................................... 19
1.6 Современные особенности туберкулеза на фоне COVID-19 ....................... 22
1.7 Внутрибольничное распространение COVID-19 .......................................... 23
1.8 Современные технологии контроля эпидемического процесса инфекций,
связанных с оказанием медицинской помощи ....................................................... 24
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЯ .................................... 27
2.1 Программа и план исследования..................................................................... 27
2.3 Характеристика территории наблюдения ...................................................... 29
2.4 Материалы исследования................................................................................. 29
2.5 Методы исследования ...................................................................................... 39
2.5.1 Эпидемиологические методы исследования ................................................. 40
2.5.2 Клинико-лабораторные методы исследования .............................................. 41
2.5.3 Микробиологические методы исследования ................................................. 42
2.5.4 Определение лекарственной чувствительности M. tuberculosis .................. 43
2.5.5 Молекулярно-генетические методы исследования ....................................... 43
2.5.5.1 Определение генотипа и геноваринтов SARS-CoV-2 ............................ 43
2.5.5.2 Определение генотипа и клональных линий M. tuberculosis ................. 44
ГЛАВА 3. ОСОБЕННОСТИ ПРОЯВЛЕНИЙ ЭПИДЕМИЧЕСКОГО ПРОЦЕССА
ТУБЕРКУЛЕЗА НА ТЕРРИТОРИИ КУЗБАССА В ПЕРИОД ПАНДЕМИИ
COVID-19 ....................................................................................................................... 47
3.1 Характеристика эпидемического процесса туберкулеза в допандемический
период ......................................................................................................................... 47
3.2 Характеристика эпидемического процесса туберкулеза в пандемический
период ......................................................................................................................... 56
ГЛАВА 4. ОСОБЕННОСТИ ПРОЯВЛЕНИЙ ЭПИДЕМИЧЕСКОГО ПРОЦЕССА СOVID˗19 В КУЗБАССЕ .............................................................................................. 60
4.1 Эпидемические циклы СOVID-19 в Кузбассе ............................................... 60
4.2 Заболеваемость COVID-19 в различных группах наблюдения ...................... 62
4.3 Смертность и летальность от COVID-19 ....................................................... 71
ГЛАВА 5. МОЛЕКУЛЯРНО- ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА M. TUBERCULOSIS НА ТЕРРИТОРИИ КУЗБАССА ................................................ 76
5.1 Изучение роли различных клонов M. tuberculosis в распространении туберкулеза с множественной лекарственной устойчивостью ............................ 76
5.2 Лекарственная устойчивость M. tuberculosis ................................................. 79
5.3 Основные клинико-диагностические характеристики туберкулеза, вызванного различными генотипами и субтипами M. tuberculosis ..................... 81
5.4 Распространение геновариантов SARS-CoV-2 на территории Кузбасса ... 85
ГЛАВА 6. КЛИНИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА COVID-19 У БОЛЬНЫХ ТУБЕРКУЛЕЗОМ .......................................................................................................... 87
6.1 Характеристика COVID-19 в основной популяции и у больных туберкулезом .............................................................................................................. 87
6.2. Характеристика COVID-19 среди больных ВИЧ-инфекцией, осложненной туберкулезом .............................................................................................................. 94
ГЛАВА 7. ПРОФИЛАКТИКА ВНУТРИБОЛЬНИЧНОГО РАСПРОСТРАНЕНИЯ SARS-CoV-2 И ПРОТИВОЭПИДЕМИЧЕСКИЕ МЕРОПРИЯТИЯ В ПРОТИВОТУБЕРКУЛЕЗНЫХ МЕДИЦИНСКИХ ОРГАНИЗАЦИЯХ ................ 104
7.1 Основные принципы профилактики ............................................................. 104
ЗАКЛЮЧЕНИЕ ........................................................................................................... 110
ВЫВОДЫ ..................................................................................................................... 118
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ ..................................................................... 123
ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ .................................... 124
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ ........................................................................................... 125
ПРИЛОЖЕНИЯ ........................................................................................................... 151
Приложение А ......................................................................................................... 151
Приложение Б .............................................................................................................. 159
Приложение В .............................................................................................................. 170
