ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ ............................................................................................................................................. 4
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ .................................................................................................... 8
1.1. Общая характеристика энтеровирусов ..................................................................................... 8
1.1.1. Современные представления об энтеровирусах ........................................................... 8
1.1.2. Классификация энтеровирусов ..................................................................................... 10
1.1.3. Строение вириона и генома ........................................................................................... 11
1.1.4. Жизненный цикл вируса ................................................................................................ 14
1.1.5. Клеточные рецепторы энтеровирусов .......................................................................... 15
1.1.6. Физико-химические свойства вириона энтеровируса ................................................ 17
1.1.7. Клинические проявления энтеровирусной инфекции ................................................ 18
1.2. Рекомбинация энтеровирусов ................................................................................................. 19
1.3. Байесовский подход в филогенетике ...................................................................................... 23
1.4. Рекомбинация у неполиомиелитных энтеровирусов ............................................................ 25
1.5. Межвидовая передача энтеровирусов .................................................................................... 32
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ .......................................................................................... 35
2.1. Штаммы вирусов и культуры клеток, использованные в работе ........................................ 35
2.1.1. Штаммы энтеровирусов вида А .................................................................................... 35
2.1.2. Штаммы энтеровирусов вида В .................................................................................... 41
2.1.3. Прототипные штаммы энтеровирусов ......................................................................... 41
2.1.4. Клеточные линии............................................................................................................ 42
2.2. Молекулярно-биологические методы исследования ............................................................ 43
2.2.1. Выделение РНК .............................................................................................................. 43
2.2.2. Обратная транскрипция in vitro .................................................................................... 43
2.2.3. Постановка полимеразной цепной реакции ................................................................ 44
2.2.4. Электрофорез ПЦР-продуктов и очистка образцов .................................................... 51
2.3. Определение нуклеотидной последовательности ................................................................. 52
2.4. Анализ нуклеотидных последовательностей ......................................................................... 53
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ ................................................................................ 54
3
3.1. Получение нуклеотидных последовательностей энтеровирусов ........................................ 54
3.2. Филогенетическое взаимоотношение участка генома VP1 энтеровирусов человека IIIII
вида А ........................................................................................................................................ 57
3.3. Филогенетическое взаимоотношение участка генома 2C энтеровирусов человека 00
вида А ........................................................................................................................................ 60
3.4. Филогенетическое взаимоотношение участка генома 3D энтеровирусов человека 00
вида А ........................................................................................................................................ 63
3.5. Анализ филогенетических отношений трех областей генома энтеровирусов человека
вида А ........................................................................................................................................ 66
3.6. Филогенетическое взаимоотношение штаммов О72 и Т75 энтеровирусов вида В ........... 83
3.7. Филогенетическое взаимоотношение участка генома 2С вируса везикулярной болезни
свиней штамма Т75 и энтеровирусов вида В ......................................................................... 87
3.8. Филогенетическое взаимоотношение участка генома 3D вируса везикулярной болезни
свиней штамма Т75 и энтеровирусов вида В ......................................................................... 89
3.9. Анализ полногеномных последовательностей вируса везикулярной болезни свиней
штамма Т75 и энтеровирусов вида В ..................................................................................... 91
ЗАКЛЮЧЕНИЕ .................................................................................................................................... 94
ВЫВОДЫ .............................................................................................................................................. 97
ПРАКТИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ .............................................................................................. 98
ПЕРСПЕКТИВЫ ДАЛЬНЕЙШЕЙ РАЗРАБОТКИ ТЕМЫ .............................................................. 98
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ ....................................................... 99
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ .................................................................................................................. 101
