ВВЕДЕНИЕ ............................................................................................... 5
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ....................................................... 11
1.1. Ботаническая, биологическая и хозяйственная характеристика
злаковых трав ..................................................................................................... 11
1.1.1. Основные направления селекции кормовых злаковых трав .... 12
1.1.2. Райграс пастбищный (Lolium perenne L.) .................................. 14
1.1.3. Райграс однолетний (Lolium multiflorum Lam.) ......................... 16
1.1.4. Фестулолиум (× Festulolium F. Aschers. et Graebn.) .................. 17
1.2. Использование ДНК-маркеров в селекционно-генетических
исследованиях многолетних злаковых трав ..................................................... 19
1.2.1. Методы, основанные на блот-гибридизации, ДНК-чип
технологиях и секвенировании...................................................................... 21
1.2.2. Методы, основанные на полимеразной цепной реакции (ПЦР)
......................................................................................................................... 24
1.3. Изучение генетического полиморфизма злаковых трав для
использования в практической селекции и семеноводстве ............................. 30
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ............................................... 39
2.1. Объекты исследования ................................................................... 39
2.2. Микросателлитные (SSR) маркеры для анализа сортов
многолетних злаковых трав............................................................................... 42
2.3. SCoT-маркеры для анализа сортов многолетних злаковых трав . 45
2.4. Методы оценки внутрисортового ДНК-полиморфизма
многолетних злаковых трав............................................................................... 46
2.5. Методы статистической обработки данных.................................. 46
2.6. Методы валидации полученных данных....................................... 47
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ ................................... 49
3.1. Оптимизация способов выделения ДНК.......................................... 49
3.2. Модификация условий ПЦР для оценки межсортового и
внутрисортового полиморфизма ....................................................................... 563
3.3. Анализ сортов райграса пастбищного с использованием SSRмаркеров ............................................................................................................. 61
3.3.1. Отбор информативных маркеров для дифференциации сортов
райграса пастбищного.................................................................................... 61
3.3.2. Анализ внутрисортового ДНК-полиморфизма сортов райграса
пастбищного ................................................................................................... 65
3.3.3. Изучение особенностей генетической структуры коллекции
сортов райграса пастбищного по результатам анализа с использованием
SSR-маркеров ................................................................................................. 70
3.4. Анализ сортов райграса пастбищного с использованием SCoTмаркеров ............................................................................................................. 74
3.4.1. Отбор информативных маркеров для дифференциации сортов
райграса пастбищного.................................................................................... 74
3.4.2. Изучение особенностей генетической структуры сортов
райграса пастбищного по результатам анализа с использованием SCoTмаркеров.......................................................................................................... 76
3.5. PCoA-анализ сортов райграса пастбищного на основе данных,
полученных при генотипировании с использованием SSR- и SCoT-маркеров
............................................................................................................................. 78
3.6. Верификация результатов анализа, полученных с использованием
SSR- и SCoT-маркеров....................................................................................... 80
3.7. Молекулярно-генетические формулы сортов райграса пастбищного
(Lolium perenne L.), разработанные на основе данных, полученных с
использованием SSR- и SCoT-маркеров ........................................................... 86
3.8. Анализ сортов райграса однолетнего с использованием SSRмаркеров ............................................................................................................. 91
3.8.1. Отбор информативных маркеров для дифференциации сортов
райграса однолетнего ..................................................................................... 91
3.8.2. Изучение особенностей генетической структуры сортов
райграса однолетнего по результатам анализа с использованием SSRлокусов............................................................................................................ 94
3.9. Анализ сортов райграса однолетнего с использованием SCoTмаркеров ............................................................................................................. 96
3.9.1. Отбор информативных маркеров для дифференциации сортов
райграса однолетнего ..................................................................................... 96
3.9.2. Изучение особенностей генетической структуры сортов
райграса однолетнего по результатам анализа с использованием SCoTмаркеров.......................................................................................................... 984
3.10. PCoA-анализ по результатам генотипирования сортов райграса
однолетнего с использованием SSR- и SCoT-маркеров................................... 99
3.11. Составление молекулярно-генетических формул для сортов
райграса однолетнего по результатам анализа с использованием SSR- и
SCoT-маркеров ................................................................................................. 101
3.12. Анализ сортов фестулолиума с использованием SSR-маркеров 103
3.12.1. Отбор информативных маркеров для дифференциации сортов
фестулолиума ............................................................................................... 103
3.12.2. Анализ внутрисортового ДНК-полиморфизма сортов
фестулолиума ............................................................................................... 105
3.12.3. Изучение особенностей генетической структуры сортов
фестулолиума по результатам анализа с использованием SSR-маркеров 109
3.13. Анализ сортов фестулолиума с использованием SCoT-маркеров
........................................................................................................................... 110
3.13.1. Отбор информативных маркеров для дифференциации сортов
фестулолиума ............................................................................................... 110
3.14. Молекулярно-генетические формулы сортов фестулолиума,
разработанные на основе данных, полученных с использованием SSR- и
SCoT-маркеров ................................................................................................. 112
3.15. Разработка молекулярно-генетических паспортов для сортов
райграса и фестулолиума................................................................................. 114
ЗАКЛЮЧЕНИЕ.................................................................................... 116
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ И УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ.... 118
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ................................................................... 119
ПРИЛОЖЕНИЯ ................................................................................... 119
