СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ………………………………………………….. 4
ВВЕДЕНИЕ …………………………………………………………………… 6
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ………………………………………….. 16
1.1. Таксономия флавивирусов…………………………………………. 16
1.2. Строение вириона и организация генома вируса клещевого
энцефалита………………………………………………………………. 20
1.3. Характеристика Европейского субтипа вируса клещевого
энцефалита ………………………………………………………………… 28
1.4. Вопросы дивергенции и эволюции вируса клещевого энцефалита .. 40
Глава 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ……………………………………… ... 44
2.1. Материалы исследования…………………………………………... 44
2.1.1. Штаммы вируса клещевого энцефалита………………….. 45
2.1.2. Нуклеотидные и аминокислотные последовательности из
электронной базы данных GenBank…………………………………………… 45
2.1.3. Клеточные культуры……………………………………… . 49
2.2. Методы исследования………………………………………………. . 49
2.2.1. Вирусологические методы…………………………………. 49
2.2.2. Молекулярно-генетические методы………………………. 52
2.2.3. Филогенетические методы ……………………………….. . 54
Глава 3. РЕЗУЛЬТАТЫ АНАЛИЗА ГЕНОМОВ ШТАММОВ ЕВРОПЕЙСКОГО
СУБТИПА ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА ИЗ ЭЛЕКТРОННЫХ БАЗ
ДАННЫХ GENBANK…………………………………………………………. 56
Глава 4. ГЕНЕТИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ ШТАММОВ ЕВРОПЕЙСКОГО
СУБТИПА ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА, ЦИРКУЛИРУЮЩЕГО В
ЗАПАДНОЙ И ВОСТОЧНОЙ СИБИРИ……………………………………… 75
Глава 5. ХАРАКТЕРИСТИКА ФЕНОТИПИЧЕСКИХ СВОЙСТВ ШТАММОВ
ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА ЕВРОПЕЙСКОГО СУБТИПА,
ИЗОЛИРОВАННЫХ НА ТЕРРИТОРИИ 3
СИБИРИ……………………………………………………………………… 85
Глава 6. ЭКОЛОГО-ГЕОГРАФИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА РАЙОНОВ
ИЗОЛЯЦИИ ШТАММОВ ЕВРОПЕЙСКОГО СУБТИПА ВИРУСА
КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА……………………………………………… 99
Глава 7. ОПРЕДЕЛЕНИЕ ЭВОЛЮЦИОННОГО ВОЗРАСТА ПОПУЛЯЦИИ
ВИРУСА КЛЕЩЕВОГО ЭНЦЕФАЛИТА ЕВРОПЕЙСКОГО СУБТИПА НА
ТЕРРИТОРИИ ЗАПАДНОЙ И ВОСТОЧНОЙ СИБИРИ…………………… 113
ЗАКЛЮЧЕНИЕ………………………………………………………………. 121
ВЫВОДЫ……………………………………………………………………… 131
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ…………………………………………………... 133
