ОГЛАВЛЕНИЕ
ВВЕДЕНИЕ 4
1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 15
1.1 Молекулярно-генетическая характеристика вируса АЧС 15
1.2 История развития современной панзоотии АЧС (2007- 2024 гг.) 21
1.3 Маркерные области генома при кластеризации изолятов 35
1.4 Заключение по обзору литературы 45
2. СОБСТВЕННЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ 47
2.1 Материалы и методы исследований 47
3. РЕЗУЛЬТАТЫ СОБСТВЕННЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ И ИХ
ОБСУЖДЕНИЕ 62
3.1 Полногеномный анализ изолятов вируса АЧС, выделенных в 2018-
2023 гг. на территории Российской Федерации 62
3.1.1 Изучение внутрикластерного распространения генетических
вариантов вируса АЧС в Приморском и Забайкальском краях 62
3.1.2 Молекулярно-генетическая характеристика вируса,
циркулирующего в популяции дикого кабана Калининградской
области (2018-2019 гг.) 70
3.1.3 Уникальный нуклеотидный полиморфизм, обнаруженный у
изолятов из Центральной России и Дальнего Востока (2019-2022 гг.) 81
3.1.4 Идентификация генетических вариантов вируса, выделенного от
домашних свиней у левобережья Днепра в 2023 году 9 7
3.2 Анализ генетических вариантов маркерных областей генома
вируса АЧС 109
3.2.1 Классификация генетических вариантов центральной
вариабельной области (CVR) гена B602L 109
3.2.2 Анализ инсерций тандемных повторов в межгенных областях
I73R/I329L и MGF 505-9R/10R 119
3
3.2.3 Анализ циркуляции вируса АЧС в Калининградской области на
основе трёх генетических маркеров (K145R, O174L, MGF 505-5R) 122
3.3 Филогеномика вируса АЧС II генотипа на территории Евразии
(2007-2023 гг.): филодинамика, филогеография и субгенотипирование 130
3.3.1 Филодинамический анализ 130
3.3.2 Филогеографический анализ 138
3.3.3 Субгенотипирование вируса АЧС генотипа II 144
4. ЗАКЛЮЧЕНИЕ 154
4.1 Итоги исследований 154
4.2 Практические предложения 155
4.3 Перспективы дальнейшей разработки 156
5. СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ 158
6. СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ 159
ПРИЛОЖЕНИЯ 182
Приложение 1 183
Приложение 2 186
Приложение 3 204
Приложение 4 207
