Введение
Глава 1. (Обзор литературы) 7
1 . Белковые комплексы, контролирующие структуру хроматина и транскрипцию генов
1.1. Типы структурной организации хроматина промоторных областей 7 генов дрожжей.
1.2. АТФ-зависимые комплексы реорганизации структуры хроматина 10 (ATP-Dependent Chromatin-Remodeling Complex).
1.2.1 Структура комплексов и характеристика субъедениц. 10
1.2.2. Характеристика активностей и механимы действия белковых комплексов, осуществляющих перестройку структуры хроматина . 15
1.2.3. Взаимодействие с промоторами. 18
1.2.4. Комплексы реорганизации структуры хроматина и клеточный цикл. 21
1.3 Белковые комплексы, модифицирующие структуру хроматина. 22
1.3.1 Гистонацетилтрансферазные комплексы дрожжей. 22
1.3.2. Гистонацетилтрансферазные комплексы человека. 27
1.3.3 Гистонацетилтрансферазный комплекс MSL Drosophila. 1.4 Взаимодействие комплексов модификации гистонов и комплексов 30 АТФ-зависимой перестройки хроматина при регуляции экспрессии генов.
1.5 Транскрипционные коактиваторы не влияющие непосредственно 32 на изменение структуры хроматина при активации экспрессии генов.
1.5.1. Факторы, взаимодействующие с ТВР (ТВР associated factors ).
1.5.2 Медиатор SRB. 35
1.6. Транскрипционные факторы Rapl, Abfl, Rebl. 38
1.7 Ген SUP35 дрожжей S. cerevisiae - его роль в контроле трансляции 41 и других клеточных процессах.
Глава 2. Материалы и методы. 46
2.1. Штаммы и плазмиды, использованные в работе .
2.2 Среды и условия культивирования. 53
2.3. Генетические методы. 54
2.4. Молекулярно-биологические методы
2.4.1. Сайт-направленный мутагенез. 55
2.4.2. Определение активности р-галактозидазы.
2.4.3. Непрямое концевое мечение. 2.4.4 Геномный футпринтинг in vivo.
2.5. Статистическая обработка результатов. 62
Глава 3. Результаты. 62
3.1. Анализ структурной организации хроматина гена SUP35 методом "непрямого мечения концов".
3.2. Анализ мест ДНК-белкового взаимодействия in vivo в 66 промоторной области гена SUP35.
3.3. Анализ влияния промоторных мутаций на функции гена SUP35
3.4 Анализ влияния промоторных мутаций на экспрессию гена SUP35 77
3.5 Оценка количества белка гена SUP35 у промоторных мутантов. 81
3.6. Оценка влияния мутаций в кодонах АТГ гена SUP35 дикого типа 83
и аллели sup35-AAB\ на жизнеспособность дрожжей.
3.7. Изучение влияния компонентов комплексов SWI/SNF и SAGA 85
на экспрессию гена SUP35.
Глава 4. Обсуждение 88
Выводы 103
Список литературы
