Введение
Глава 1. Паразитарная система клещевого энцефалита и надзор за эпидемическими проявлениями природных очагов заболевания (обзор литературы) 17
1.1. Таксономия, классификация, генетическая вариабельность вируса клещевого энцефалита 17
1.2. Патогенные свойства вируса клещевого энцефалита и их связь с генетическими факторами 19
1.3. Вирус клещевого энцефалита в целостной паразитарной экосистеме (современные воззрения) 24
1.4. Факторы, детерминирующие заболеваемость человека клещевым энцефалитом 30
1.5. Использование инструментов ГИС в эпидемиологическом надзоре за природно-очаговыми инфекциями 38
Глава 2. Материалы и методы 43
2.1. Материалы 43
2.1.1. Полевой материал 43
2.1.2. Материал от больных людей 45
2.1.3. Музейные штаммы вируса клещевого энцефалита 45
2.1.4. Лабораторные животные 46
2.1.5. Материалы по заболеваемости клещевым энцефалитом 46
2.2. Методы исследований 46
2.2.1. Зоолого-паразитологические методы 46
2.2.2. Серологические методы 47
2.2.3. Вирусологические методы 48
2.2.4. Молекулярно-генетические методы 49
2.2.5. Методы электронного картографирования 49
2.2.6. Методы статистической обработки материала 50
Глава 3. Обоснование выбора ключевых участков и их ландшафтно-климатическая характеристика 51
Глава 4. Пространственно-временные особенности системы клещ – возбудитель клещевого энцефалита в Прибайкалье 59
4.1. Видовой состав иксодовых клещей на ключевых участках и особенности пространственного распределения Ixodes persulcatus P. Sch. 59
4.2. Разработка способа адекватной оценки обилия таёжного клеща в условиях Прибайкалья 62
4.3. Многолетняя и сезонная динамика численности таёжного клеща в различных ландшафтно-экологических условиях 67
4.4. Вирусофорность иксодовых клещей и её вариативность в пространстве и времени 75
Глава 5. Прокормители иксодовых клещей в Прибайкалье 89
5.1. Видовой состав и численность мелких млекопитающих – основных прокормителей предимагинальных стадий иксодовых клещей – в Прибайкалье, их изменения во времени 89
5.2. Поражённость мелких млекопитающих предимагинальными стадиями иксодовых клещей 98
5.3. Зараженность мелких млекопитающих вирусом клещевого энцефалита 110
Глава 6. Характеристика штаммов вируса клещевого энцефалита и структура вирусной популяции 114
6.1. Общая характеристика штаммов, выделенных из разных источников 115
6.2. Молекулярно-генетическая характеристика штаммов и изолятов РНК и генотипическая структура вируса клещевого энцефалита, циркулирующего в природных очагах Прибайкалья 122
6.3. Гетерогенность патогенных свойств выделенных штаммов 133
Глава 7. Пространственно-временные изменения заболеваемости клещевым энцефалитом 144
7.1. Создание базы данных о случаях заражения клещевым энцефалитом с целью эколого-эпидемиологического мониторинга 144
7.2. Динамика и тенденции заболеваемости клещевым энцефалитом при заражении на различных территориях Прибайкалья с 1995 по 2015 г. 147
7.3. Пространственное распределение случаев заражения людей клещевым энцефалитом в природных очагах Прибайкалья 168
7.4. Влияние некоторых экологических и социально-демографических факторов на эпидемические проявления клещевого энцефалита 181
Глава 8. Связь пространственно-временных изменений компонентов паразитарной системы клещевого энцефалита в Прибайкалье с эпидемическими проявлениями 191
Заключение 209
Выводы 227
Список основных сокращений 230
Словарь терминов 231
Список литературы 238
Приложения 284
