Введение
ГЛАВА 1. Обзор литературы 6
1.1. Прыткая ящерица - Lacerta Agilis Linnaeus, 1758 6
1.1.1. Внешний вид 6
1.1.2. Распространение прыткой ящерицы, Lacerta agilis 7
1.1.3. Образ жизни 10
1.2. Положение прыткой ящерицы, lacerta agilis, в системе настоящих ящериц 11
1.3. Подвидовая структура вида lacerta agilis 13
1.4. Происхождение и филогения прыткой ящерицы, lacerta agilis 26
1.5. Молекулярные аспекты изучения филогении и систематики 29
1.5.1. Митохондриальный геном 31
1.5.2. Цитохром b 38
1.5.3. Филогеография 40
ГЛАВА 2. Материал и методы исследования 42
2.1. Материал 42
2.2. Лабораторные протоколы 45
2.2.1. Выделение тотальной ДНК 45
2.2.2. Полимеразная Цепная Реакция 47
2.2.3. Очистка ПЦР-продуктов для АВІЗ 100 49
2.2.4. "Cycle Sequencing" реакция и секвенирование 49
2.3. Обработка и филогенетический анализ полученных данных 51
2.3.1. Генетические дистанции 53
2.3.2. Дистанционный метод 54
2.3.3. Кладистические методы 54
2.3.4. „Bootstrap" анализ 57
ГЛАВА 3. Результаты 58
3.1. Подлинность митохондриальной ДНК 58
3.2. Характеристика цитохрома в ящериц вида Lacerta Agilis 59
3.2.1. Нуклеотидный состав 59
3.2.2. Замены нуклеотидов 60
3.2.3. Транзиции и трансверсии 62
3.2.4. Аминокислотный состав 63
3.2.5. Вариабельность в пределах цитохрома b 64
3.3. Генетические дистанции 66
3.4. Филогенетический анализ 67
3.4.1. Монофилия прыткой ящерицы, Lacerta agilis и взаимоотношения зеленых ящериц Lacerta s. str 67
3.4.2. Внутривидовые взаимоотношения прыткой ящерицы, Lacerta agilis 69
ГЛАВА 4. Обсуждение 78
4.1. Монофилия вида lacerta agilis 78
4.2. Сравнение молекулярных и морфологических данных о взаимоотношениях ящериц вида lacerta agilis. 79
4.3. Филогеография вида lacerta agilis 89
4.4. Систематика и подвидовое деление lacerta agilis 97
Выводы 100
Благодарности 102
Список использованной литературы
