Введение
Глава 1 Обзор литературы 8
1.1 Общая характеристика рода 8
1.1.1 Внешний вид 8
1.1.2 Систематическое положение вида 9
1.1.3 Распространение 10
1.1.4 Социальная структура и размножение 11
1.1.5 Пища и кормодобывательные стратегии 13
1.1.6 Численность 14
1.1.7 Адаптации 17
1.1.8 Филогеографическая структура вида 17
1.2 Природа и климат Командорских островов 19
1.2.1 Краткая физико-географическая характеристика Командорских островов 19
1.2.2 Климат Командорских островов 20
1.2.3 Растительный и животный мир островов 20
1.3 Командорские подвиды песца 21
1.3.1 Современные представления о систематическом положении Командорских подвидов песца .21
1.3.2 История командорских популяций песца 25
1.3.3 Экологические особенности островные командорских подвидов песцов 29
Невозможность миграции 29
Богатые кормовые ресурсы 30
Отсутствие хищничества и межвидовой конкуренции 30
Понуляционная структура 31
1.3.4 Генетические исследования командорских песцов и не выясненные/спорные вопросы 32
1.4 Митохондриальный геном позвоночных 33
1.5 Главный Комплекс Гистосовместимости 36
1.6 Генетические особенности островных популяций 40
Глава 2 Материалы и методы : 44
2.1 Полевые исследования и методы их обработки 44
2.1.1 Сбор материала 44
2.1.2 Качество выборки 45
2.1.3 Контроль за загрязнением 50
2.1.4 Выделение суммарной ДНК из мышц и кожи 50
2.1.5 Подбор праймеров для анализа контрольного региона мтДНК 52
2.1.6 Амплификация фрагмента контрольного региона мтДНК 53
2.1.7 Амплификацию фрагмента второго экзона гена главного комплекса гистосовместимости второго класса DRB1 53
2.1.8 Очистка ПЦР продуктов 53
Выделение из геля 53
Очистка ПЦР продукта с помощью щелочной фосфотазы и экзонуклезы 54
2.1.9 Определение первичной последовательности нуклеотидов ДНК 54
Очистка продуктов сиквенсной нолимеразной цепной реакции: 57
2.2 Статистическая обработка молекулярно-генетических данных 59
2.2.1 Выравнивание последовательностей 59
2.2.2 Выбор оптимальной эволюционной математической модели 60
2.2.3 Дифференциация популяций. 61
2.2.4 Скорректированная межгрушювая генетическая дистанция 61
2.2.5 Эффективная численность самок 61
2.2.6 Медианные сети гаплотипов 61
2.2.7 Построение деревьев 62
Глава 3 Исследование полиморфизма мтднк у командорских песцов 62
3.1 Сбор образцов 62
3.2 Качество выборки 62
3.3 Исследование контрольного региона мтДНК у командорских песцов 63
3.3.1 Гаплотипическое (h) и нуклеотидное (я) разнообразие последовательностей командорских песцов 66
Глава 4 Степень генетической изоляции командорских популяций песцов 74
Глава 5 Происхождение, история и время изоляции командорских песцов 77
5.1 Происхождение командорских популяций песцов
5.2 Определение времени изоляции командорских подвидов песцов 80
Глава 6 Анализ второго экзона гена drb1 в популяциях командорских песцов.. 84
6.1 Анализ полиморфизма второго экзона гена DRB1 в популяции песцов о. Медный 84
6.2 Анализ полиморфизма второго экзона гена DRB1 в популяции песцов о. Беринга 89
6.3 Трансспецифичный полиморфизм по генам МНС в семействе псовых 90
Выводы: і 94
Приложение 1 95
Благодарности
