Введение
ГЛАВА 1. Обзор литературы 11
1. 1. Характеристика трематод рода Leucochloridium 12
1. 1. 1. Жизненный цикл трематод рода Leucochloridium 13
1. 1. 2. Распространение трематод рода Leucochloridium 16
1. 1. 3. Особенности организации партенит трематод рода Leucochloridium
1. 2. Подходы к изучению генома и молекулярные маркеры, используемые для генотипирования трематод 25
1. 2. 1. Анализ кластера рибосомной ДНК 26
1. 2. 2. Анализ митохондриальной ДНК 32
1. 2. 3. Анализ тандемно повторяющихся последовательностей 33
1. 3. Филогения и система трематод 34
1. 3. 1. Системы построенные на основе морфологических и кариологических признаках 36
1. 3. 2. Филогенетические построения, основанные на использовании молекулярных маркеров 42
ГЛАВА 2. Материалы и методы 46
2. 1. Объекты исследования и сбор материала 46
2. 2. Оборудование и материалы 46
2. 3. Сравнительно-морфологический анализ 49
2. 4. Молекулярно-генетический анализ 49
2. 5. Методы работы с нуклеотидными последовательностями 54
ГЛАВА 3. Результаты и обсуждение 55
3. 1. Общее описание спороцист Leucochloridium paradoxum, L. perturbatum и L. vogtianum з
3. 1. 1. Трематоды Leucochloridium paradoxum 56
3. 1. 2. Трематоды Leucochloridium perturbatum 59
3. 1. 3. Трематоды Leucochloridium vogtianum 61
3. 2. Создание банка ядерной ДНК трематод р. Leucochloridium 63
3. 2. 1. Характеристика исследуемых образцов ДНК 63
3. 3. Анализ ДНК трематод р. Leucochloridium с помощью случайных праймеров (RAPD-анализ) 64
3. 4. Анализ ДНК трематод р. Leucochloridium с помощью специфических праймеров 69
3. 4. 1. Дизайн специфических праймеров 69
3. 4. 2. Анализ нуклеотидных последовательностей рДНК трематод Leucochloridium sp. 74
3. 4. 3. Вторичные структуры последовательностей рРНК трематод рода Leucochloridium 78
3. 4. 4. Характеристика полиморфизмов нуклеотидных последовательностей, входящих в кластер генов рРНК трематод рода Leucochloridium 81
3. 5. Филогенетический анализ трематод рода Leucochloridium 84
Заключение 103
Выводы 109
Список сокращений, используемых в тексте .110
Список литературы
