Введение
Глава 1. Обзор литературы 9
1.1. Онкогены и гены-супрессоры опухолевого роста 9
1.1.1. Ген NETO2 - потенциальный онкоген СРП 14
1.1.2. Ген NR0B2 - потенциальный супрессор СРП 16
1.2. Энергетический обмен в опухолевых клетках 18
1.2.1. Гликолиз 20
1.3. Метаболизм ретинола и его нарушение при раке 24
1.3.1. Ретинол 25
1.3.2. Метаболизм ретинола в клетке 26
1.3.3. Механизм действия рецепторов ретиноидов 29
1.3.4. Экспрессия генов, кодирующих ферменты биосинтеза ретиноевой кислоты 32
1.3.5. Биологическая роль продуктов метаболизма ретинола 33
1.4. Способы эпигенетической регуляции экспрессии генов 34
1.4.1. МикроРНК 34
1.4.2. Метилирование 42
1.4.3. Модификации гистонов 44
1.5. Методы оценки уровня мРНК генов 45
Глава 2. Материалы и методы исследований 52
2.1. Материалы 52
2.1.1. Образцы тканей 52
2.2. Методы исследований 52
2.2.1. Выделение нуклеиновых кислот 52
2.2.2. Реакция обратной транскрипции 53
2.2.3. Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени 54
2.2.4. Математическая обработка данных ПЦР-РВ 55
2.2.5. Анализ метилирования 57
2.2.6. Подготовка библиотек микроРНК 57
Глава 3. Результаты и обсуждение 59
3.1. Разработка методической базы для ПЦР-РВ 59
3.2. Биоинформатический анализ экспрессии генов, кодирующих ферменты гликолиза 59
3.2.1. Количественная оценка относительного уровня мРНК генов, кодирующих ферменты гликолиза 61
3.3. Биоинформатический анализ экспрессии генов, кодирующих компоненты метаболизма ретинола 76
3.3.1. Количественная оценка относительного уровня мРНК генов, кодирующих компоненты метаболизма ретинола 78
3.4. Бионформатический поиск потенциальных молекулярных маркеров СРП 102
3.4.1. Количественная оценка относительного уровня мРНК гена NETO2 и регуляция его экспрессии 103
3.4.2. Количественная оценка относительного уровня мРНК гена NR0B2 и регуляция его экспрессии 107
Заключение 110
Выводы 112
Список литературы 113
