Введение
Глава 1. Полигоны захоронения тврдых бытовых отходов городов 10
1.1. Общие сведения 10
1.2. Экологическая характеристика 12
1.3. ПТБО как источники образования и эмиссии метана 14
1.4. Сточные воды и их микрофлора 17 Глава 2. Обмен веществ на полигонах ТБО 22
2.1. Обмен углерода 22
2.1.1. Роль в глобальном газообмене 22
2.1.2. Превращения одноуглеродных соединений 24
2.1.3. Образование и окисление метана 25
2.2. Обмен азота 27
2.2.1. Общие сведения 27
2.2.2. Структура бактериального цикла азота в водных системах 27
2.2.3. Аммонификация 28
2.2.4. Нитратредукция и денитрификация 30
2.2.5. Нитрификация 31
Глава 3. Характеристика протеобактерий как космополитов
3.1. Распространение протеобактерий на очистных сооружениях 33
3.2. Метано- и метилотрофные бактерии 35
3.3. Метилотрофия как научное направление 36
3.4. Биотехнологический потенциал метилотрофных бактерий 38
Экспериментальная часть 46
Глава 4. Объекты и методы исследований 46
4.1. Методы лабораторных исследований 47
4.1.1. Гидрохимические анализы фильтрационных вод 47
4.1.2. Количественная оценка микроорганизмов 48
4.1.3. Культивирование микроорганизмов 50
4.1.4. Газохроматографический анализ активности денитрификации 50
4.1.5. Определение состава жирных кислот 52
4.1.6. Выделение ДНК из исследуемых проб in situ /ex situ з
4.1.7. ПЦР-амплификация гена 16S рРНК, клонирование, секвенирование и анализ 53
4.1.8. ПЦР-амплификация гена mxaF, клонирование, секвенирование
и анализ 55
4.1.9. Подсчт клеток и флуоресцентная in situ гибридизация (FISH) 56
4.1.10. Эксперименты с проростками 58
Результаты исследований и их обсуждение 59
Глава 5. Общая характеристика фильтрационных вод ПТБО 59
Глава 6. Молекулярная in situ детекция «культивируемых» и «не культивируемых» микроорганизмов 64
6.1. Подсчт количества клеток и филогенетических групп методом FISH 64
6.2. Анализ последовательностей генов 16S рРНК
6.2.1. Анализ сиквенсов архейных генов 16S рРНК 69
6.2.2. Анализ сиквенсов бактериальных генов 16S рРНК 72
6.3. Анализ сиквенсов генов метанолдегидрогеназы mxaF .76
Глава 7. Ex situ исследования «культивируемых» бактерий 78
7.1. Разнообразие эколого-трофических групп бактерий 78
7.2. Фенотипическая и генотипическая характеристика накопительных и чистых культур бактерий 79
7.3. Детекция метанолдегидрогеназы mxaF культур метилотрофов 84
7.4. Активность денитрификации выделенных штаммов 87
7.5. Предварительное описание новых метилотрофных денитрификаторов, изолированных из фильтрационных вод ПТБО 89
Заключение 93
Выводы 102
Писок принятых сокращений 104
Список литературы .
