Введение
1 Обзор литературы 9
1.1 Историческая справка 9
1.2 Общая характеристика актиномицинов 10
1.3 Структура комплекса АМД - ДНК 13
1.4 Специфика взаимодействия АМД с ДНК 16
1.5 Энергетика взаимодействия АМД с ДНК 17
1.6 Кинетика взаимодействия АМД и ДНК 21
1.7 Выражение Камлета-Тафта: Линейное соотношение энергии сольватации 22
1.8 Время жизни и поляризация флуоресценции. Уравнение Левшина -Перрена 41
1.9 Флуориметрия в остановленном потоке (stopped flow) 43
1.10 Флуоресцентная корреляционная спектроскопия 45
1.11 Уравнение Фредгольма первого рода 52
1.12 Уравнение гетерогенной адсорбции Фрейндлиха 57
2 Материалы и методы 59
2.1 Используемые реактивы 59
2.2 Регистрация спектров флуоресценции 7аАМД и его комплексов с ДНК, измерение поляризации и времени жизни флуоресценции 59
2.3 Корреляционный анализ 60
2.4 Флуориметрия в остановленном потоке 61
2.5 Поиск оптимального алгоритма обработки КФ и их последующий анализ 61
2.6 Поиск оптимальной по энергии структуры 7аАМД при помощи молекулярной динамики 62
2.7 Измерения на установке ConfoCor 63
2.8 Уравнение гетерогенной абсорбции Фрейндлиха 64
2.9 Устранение влияния сорбции/десорбции 7аАМД на ход эксперимента. 64
3 Результаты и обсуждение 65
3.1 Характеристика актиномицина и его комплексов с ДНК в тяжелой и обычной воде на основе спектральных данных 65
3.2 Молекулярная динамика комплекса 7аАМД сНР1 66
3.3 Анализ сольватохромного эффекта 7аАМД 69
3.4 Исследование кинетики взаимодействия 7аАМДи ДНК 84
3.5 Анализ корреляционных функций 90
3.6 Измерение поляризации флуоресценции и ФКС на установке ConfoCor 96
Заключение 109
