Введение
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Физико-географическая характеристика озера Байкал 8
1.2. История изучения районов естественных нефтепроявлений на озере Байкал 10
1.3. Химический состав байкальской нефти и характеристика районов естественных нефтепроявлений на озере Байкал 13
1.4. Разнообразие углеводородокисляющих микроорганизмов в воде и донных осадках различных экосистем мира 18
1.5. Механизмы окисления углеводородов нефти микроорганизмами и ферментативные системы 24
1.6. История изучения углеводородокисляющих микроорганизмов на озере Байкале 32
ГЛАВА 2. ОБЪЕКТЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
2.1. Объекты исследования и методы отбора проб 35
2.2. Методы исследований
2.2.1. Микробиологические методы исследования 37
2.2.2. Молекулярно-биологические методы исследования 39
2.2.3. Химические методы исследования 42
ГЛАВА 3 РЕЗУЛЬТАТЫ ИССЛЕДОВАНИЙ И ИХ ОБСУЖДЕНИЯ
3.1 Численность культивируемых углеводородокисляющих микроорганизмов в водной толще и донных осадках двух районов естественных нефтепроявлений
3.2. Естественное нефтепроявление у устья р. Б. Зеленовская 44
3.3. Естественное нефтепроявление у м. Горевой Утес
ГЛАВА 4. Молекулярно-генетическая идентификация углеводородокисляющих микроорганизмов в районах нефтепроявлений
4.1. Филогенетическое разнообразие культивируемых углеводородокисляющих микроорганизмов двух районов естественных нефтепроявлений по данным анализа нуклеотидных последовательностей фрагментов гена 16S рРНК 65
4.2. Филогенетическое разнообразие природных микробных сообществ в двух районах естественных нефтепроявлений по данным анализа нуклеотидных последовательностей фрагментов гена рРНК 83
4.2.1. М. Горевой Утес 84
4.2.2. Устье р. Б. Зеленовская 97
4.3. Исследование alk генов у культивируемых углеводородокисляющих микроорганизмов 105
ГЛАВА 5. Роль микроорганизмов в биодеградации нефти
5.1. Деградация нефти и ее компонентов в лабораторных условиях чистыми культурами 112
5.2. Деградация нефти и ее компонентов в экспериментах природным микробным сообществом 117
ЗАКЛЮЧЕНИЕ 124
ВЫВОДЫ 126
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ 128
ПРИЛОЖЕНИЯ 149
