Введение
ЧАСТЬ I. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ 7
1.1. Роль митохондрий в апоптозе 7
1.2. БЕЛКИ СЕМЕЙСТВА BCL-2 11
Антиапоптозные белки 14
Проапотозные белки 15
1.3.BNIP3 17
Смерть клеток при ишемии сердца 18
Современное представление о структуре BNIP3 20
Функция BNIP3 22
1.4. Исследование мембранных белков методом спектроскопии ЯМР. 23
Выделение мембранных белков 24
Выбор окружения моделирующего мембрану 25
Заключение 28
ЧАСТЬ II. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ 30
2.1. Выделение BNIP3 30
2.2. Приготовление образца 30
2.3. Спектроскопия ЯМР... 31
2.4. Расчет пространственной структуры 35
2.5. МД-релаксация 37
ЧАСТЬ III. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ 42
3.1. Экспериментальные данные для расчета структуры ТМ BNIP3 42
3.2. Отнесение сигналов в спектрах ЯМР 43
3.3. Элементы вторичной структуры 50
3.4. Расчет пространственной структуры 53
3.5. Минимизация конформационнои энергии экспериментальной структуры 58
3.6. Димеризационный интерфейс BNIP3 ТМ 61
3.7. Взаимодействие BNIP3 ТМ с водой 66
3.8. Связь структурно-динамических свойств BNIP3 ТМ и проапоптозной функции БЕЛКА 68
3.9. ЗАКЛЮЧЕНИЕ 70
ВЫВОДЫ 72
БЛАГОДАРНОСТИ 73
ПРИЛОЖЕНИЕ 74
СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ СОКРАЩЕНИЙ 79
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
