Введение
2 Литературный обзор 18
2.1 Методы исследования: атомно-силовая микроскопия, силовая спектроскопия и молекулярная динамика 18
2.1.1 Атомно-силовая микроскопия 18
2.1.2 Силовая спектроскопия 21
2.1.3 Молекулярная динамика 35
2.2 Объекты исследования: амилоид (3 пептид и лизоцим. Их структура, и свойства 37
2.2.1 Амилоид /3 пептид 37
2.2.2 Лизоцим 41
2.3 Влияние поверхности на конформацию молекулы. Влияние химической сорбции на конформацию молекулы 46
2.3.1 Влияние поверхности на конформацию молекул амилоид /3 пептида и их агрегацию 46
2.3.2 Влияние поверхности на конформацию молекул СМА и их агрегацию 51
2.3.3 Влияние химической сорбции на конформацию молекулы 56
2.4 Взаимодействие молекул, находящихся в состоянии с неправильной укладкой и их агрегация 57
2.4.1 Исследование взаимодействия двух молекул, находящихся в состоянии с неправильной укладкой 57
2.4.2 Переход молекул полимеров из нативной конформа-ции в состояние с неправильной укладкой приводит к последующей агрегации 58
2.5 Заключение 63
3 Экспериментальная часть 64
3.1 Атомно-силовая спектроскопия копформационно-зависимых внутрибелковых взаимодействий 64
3.1.1 Постановка задачи 64
3.1.2 Литературные данные 65
3.1.3 Подготовка образцов 67
3.1.4 Методика проведения экспериментов 71
3.1.5 Результаты основных экспериментов по исследованию межмолекулярного взаимодействия 75
3.1.6 Контрольные эксперименты 80
3.1.7 Эксперименты с длинным полиэтиленгликолевым линкером 81
3.1.8 Исследование адгезии 84
3.1.9 Выводы 86
3.2 Образование фибрилл в биополимерной системе на твердой подложке 87
3.2.1 Постановка задачи 87
3.2.2 Литературные данные 88
3.2.3 Подготовка образцов 91
3.2.4 Измерение поверхностного натяжения пленки лизоцима на поверхности кантилевера 94
3.2.5 Исследование агрегации лизоцима, химически сорбированного на золотую поверхность 95
3.2.6 Исследование агрегации лизоцима, химически сорбированного на поверхность слюды 98
3.2.7 Исследование агрегации лизоцима, физически сорбированного на различные поверхности при комнатной температуре 99
3.2.8 Исследование агрегации лизоцима, физически сорбированного на различные поверхности при температуре 50 С 101
3.2.9 Выводы 104
4 Полученные результаты и их обсуждение 107
Выводы 112
Список литературы 115
Приложения 127
