Введение
ГЛАВА 1. Черноземы, их свойства, биологическая активность, устойчивость экосистемы черноземов при интенсивном сельскохозяйственном использовании (Обзор литературы, современное состояние проблемы) 8
1.1. Трансформация свойств черноземов и их биологической активности в условиях интенсивного сельскохозяйственного производства 8
1.2. Микроорганизмы, как активный компонент почвы 27
1.3. Метагеном прокариотного сообщества почв 37
ГЛАВА 2. Природные условия и почвенный покров каменной степи 46
ГЛАВА 3. Объекты и методы исследований 52
3.1. Объекты исследования 52
3.2. Методы исследований
3.2.1. Отбор почвенных образцов 61
3.2.2. Определение форм углерода и азота 61
3.2.3. Определение численности микроорганизмов 61
3.2.4. Приготовление препарата почвенной ДНК 63
3.2.5. Проведение количественной ПЦР 63
3.2.6. Секвенирование нуклеотидных последовательностей 65
3.2.7. Обработка результатов секвенирования 65
ГЛАВА 4. Результаты и обсуждение
4.1. Взаимосвязь численности почвенных микроорганизмов эколого-трофических групп и форм углерода и азота 67
4.2. Количественная оценка различных групп микроорганизмов по данным метода ПЦР Real Time 81
4.3. Почвенный метагеном прокариотного сообщества черноземов Каменной Степи 4.4. Сезонная динамика почвенного микробиома агрочерноземов 104
4.5. Анализ биологического разнообразия таксономической структуры микробного сообщества 107
Заключение 112
Основные выводы 113
Список литературы 116
