Изменение транскриптома и паттерна распределения эпигенетической модификации H3K4me3 под действием раннего постнатального стресса в префронтальной коре у самцов мышей

Изменение транскриптома и паттерна распределения эпигенетической модификации H3K4me3 под действием раннего постнатального стресса в префронтальной коре у самцов мышей

1.5.7 - генетика Диссертация на соискание учёной степени кандидата биологических наук

Автор
Решетников Василий Владимирович
Год
2024
  • 99 000 UZS

Оглавление диссертации

Оглавление .....................................................................................................................................2
ПЕРЕЧЕНЬ УСЛОВНЫХ ОБОЗНАЧЕНИЙ ..............................................................................5
АДГ – антидиуретический гормон...............................................................................................5
ГГНС- гипоталамо-гипофизарная-надпочечниковая-система ..................................................5
ЦНС – центральная нервная система ..........................................................................................5
ВВЕДЕНИЕ....................................................................................................................................6
Цели и задачи исследования.........................................................................................................7
Научная новизна работы...............................................................................................................8
Теоретическая и научно-практическая ценность работы..........................................................9
Положения, выносимые на защиту:.............................................................................................9
Структура и объем работы .........................................................................................................12
Благодарности..............................................................................................................................12
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ.............................................................................................13
1.1. Молекулярные механизмы ответа на стресс ..............................................................13
1.2. Особенности постнатального периода развития .......................................................16
1.3. Ранний постнатальный стресс у людей ......................................................................18
1.4. Модели раннего постнатального стресса на животных............................................20
1.5. Структурные и функциональные изменения в головном мозге под действием
раннего постнатального стресса............................................................................................25
1.6. Возможные молекулярные механизмы эффектов раннего постнатального стресса
29
1.6.1. Метилирование ДНК.....................................................................................29
1.6.2. Модификации гистонов ................................................................................30
1.6.3. Некодирующие РНК .....................................................................................31
1.7. Молекулярные изменения, вызванные ранним постнатальным стрессом..............32
1.7.1. Молекулярные изменения в генах, связанных с ГГНС .............................33
1.7.2. Влияние на нейротрофический фактор мозга.............................................36
1.7.3. Влияние на процессы миелинизации ..........................................................39
1.7.4. Влияние на глутаматергическую и ГАМК-эргическую системы.............40
1.8. Влияние раннего постнатального стресса на стресс-реактивность .........................42
1.9. Модели хронического стресса во взрослом возрасте на животных ........................45
1.10. Заключение по литобзору.........................................................................................473
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.....................................................................................49
2.1. Материалы, использованные в работе................................................................................49
2.2. Животные ..............................................................................................................................50
2.3. Экспреиментальный дизайн ................................................................................................50
2.4. Процедура раннего постнатального стресса......................................................................53
2.5. Хронический стресс социальных поражений....................................................................54
2.6. Поведенческие тесты ...........................................................................................................55
2.5.1. Тест «социальное взаимодействие» ...............................................................55
2.5.2. Тест вынужденного плавания (тест Порсолта) .............................................56
2.5.3. Тест «Открытое поле» .....................................................................................57
2.5.4. Тест приподнятого крестообразного лабиринта ...........................................57
2.5.5. Тест распознавания нового объекта (novel object recognition) ....................57
2.5.6. Тест водного лабиринта Морриса (Morris’ water maze test).........................58
2.7. Иммуноферментный анализ уровня кортикостерона .......................................................59
2.8. Хроматографический анализ уровня кортикостерона ......................................................60
2.9. Выделение префронтальной коры головного мозга для молекулярных исследований
..................................................................................................................................................61
2.10. Выделение РНК ..................................................................................................................61
2.11. Реакция обратной транскрипции ......................................................................................62
2.12. Оценка экспрессии генов с помощью количественного ПЦР анализа.....................63
2.13. Иммунопреципитация хроматина с использованием антител к H3K4me3..............66
2.14. Приготовление библиотек для секвенирования ..............................................................69
2.14.1. Подготовка ДНК-библиотек из иммунопреципитатов ................................................69
2.14.2. Подготовка библиотек для RNA-seq .............................................................................72
2.15. Статистическая обработка данных ...................................................................................73
2.16. Биоинформатический анализ данных секвенирования ..................................................74
2.18.1. Анализ данных RNA-seq.................................................................................................74
2.16.2. Анализ данных ChIP-seq.................................................................................................75
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ...........................................................................................................76
3.1. Влияние раннего постнатального стресса на ГГНС у самцов мышей различных
возрастов..................................................................................................................................76
3.4. Влияние раннего постнатального стресса на поведение взрослых животных ..........77
3.5. Влияние раннего постнатального стресса на обучение и память ...............................80
3.5.1. Тест водного лабиринта Морриса ..................................................................80
3.5.2. Тест на распознавание нового объекта............................................................................814
3.6. Влияние раннего постнатального стресса на транскриптом префронтальной коры
головного мозга взрослых самцов мышей ...........................................................................84
3.7. Влияние раннего постнатального стресса на распределения метки активного
хроматина H3K4me3 во префронтальной коре с помощью метода ChIP-seq...................88
3.8. Влияние раннего постнатального стресса на чувствительность к стрессу во
взрослом возрасте ...................................................................................................................94
3.8.1. Транскриптомные изменения после воздействия стресса социальных поражений ...95
3.8.2. Влияние стресса социальных поражений на профиль H3K4me3 ...............................102
3.8.3. Взаимосвязь плотности распределения H3K4me3 в промоторе с экспрессией генов
.....................................................................................................................................................106
ГЛАВА 4. ОБСУЖДЕНИЕ РЕЗУЛЬТАТОВ......................................................................111
4.1. Длительное отделение от матерей в ранний постнатальный период не влияет на
базальную активность ГГНС у самцов мышей различных возрастов.............................111
4.2. Длительное отделение от матерей в ранний постнатальный период приводит к
снижению двигательной активности и нарушению пространственной памяти у
взрослых самцов ...................................................................................................................114
4.3. Длительное отделение от матерей в ранний постнатальный период приводит к
выраженным изменениям в экспрессии генов в префронтальной коре у взрослых
самцов ....................................................................................................................................115
4.5. Длительное отделение от матерей в ранний постнатальный период приводит к
умеренным изменениям профиля H3K4me3 в префронтальной коре у взрослых самцов
................................................................................................................................................118
4.6. Длительное отделение от матерей в ранний постнатальный период приводит к
повышению чувствительности к хроническому стрессу социальных поражений во
взрослом возрасте .................................................................................................................121
4.7. Длительное отделение от матерей в ранний постнатальный период влияет на
изменение профиля H3K4me3 в префронтальной коре взрослых самцов после
воздействия хронического стресса социальных поражений ............................................131
ЗАКЛЮЧЕНИЕ .......................................................................................................................135
ВЫВОДЫ..................................................................................................................................137
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ .....................................................................................................138
ПРИЛОЖЕНИЕ 1....................................................................................................................182
ПРИЛОЖЕНИЕ 2....................................................................................................................183
ПРИЛОЖЕНИЕ 3....................................................................................................................184
ПРИЛОЖЕНИЕ 4....................................................................................................................185

Рекомендуем вам товары

99 000 UZS
Автор
Резяпова Луиза Рустамовна
Количество страниц
118
Год
2024
99 000 UZS
Автор
Дегтярев Максим Николаевич
Количество страниц
Год
2024
99 000 UZS
Автор
Залетов Иван Сергеевич
Количество страниц
Год
2024
Модули для Opencart 2, Опенкарт 3