Введение
ГЛАВА I. Обзор литературы 13
1.1 Место двунитевых разрывов в ряду различных повреждений ДНК 13
1.2 Основные механизмы репарации двунитевых разрывов 16
1.3 Флуоресцентные методы исследования репарации ДР 20
1.3.1 Фосфорилированный вариант гистона Н2АХ как маркер ДР 20
1.3.2 Фокусы белка Rad51 как маркеры гомологической рекомбинации 27
1.3.3 Подходы к количественному анализу фокусов белков репарации 28
1.4 Предшествующие модели индукции и репарации ДР ДНК 30
ГЛАВА II. Разработка алгоритма автоматического анализа флуоресцентных изображений с фокусами белков репарации ДНК 37
II. 1 Обзор составленного алгоритма 37
П.2 Разработка и валидация алгоритма детекции ядер клеток 39
П.З Разработка и валидация алгоритма детекции фокусов 46
П.4 Графический интерфейс для запуска расчётов и анализа результатов 52
ГЛАВА III. Получение экспериментальных данных по кинетике формирования и деградации фокусов белков у-Н2АХ и Rad51 54
ПІЛ Материалы и методы 54
Ш.2 Анализ флуоресценции гистона уН2АХ в клетках линии V79 56
Ш.З Анализ флуоресценции гистона уН2АХ в клетках ПФЧ 58
Ш.4 Анализ флуоресценции белка Rad51 62
ГЛАВА IV. Построение кинетической модели индукции и репарации ДР ДНК 67
IV.1 Общий вид кинетической модели 67
IV.2 Замена переменных, подбор коэффициентов и валидация модели... 74
IV.3 Результаты моделирования 86
Заключение 97
Выводы 99
Библиографический список
