Введение
1 Аффинная модификация биополимеров фосфорилируюїдими реагентами и реагентами на основе 4-азидоарилфосфата и перфторарилазида 9
1 1 Аффинные реагенты с фосфорилирующей реакционноспособной группой и группой, потенциально способной к фосфорилированию 10
1 1 1 Фосфорилирующие аффинные реагенты - производные моно- и олигонуклеотидов, содержащие реакционноспособную группу на 5-конце 10
1 1 2 Фосфорилирующие аффинные реагенты - производные нуклеиновых кислот, содержащие реакционноспособную группу в составе межнуклеотидной пирофосфатной связи 21
1 1 3 Фотоаффинные реагенты на основе я-азидофенил- и 4-азидо-2-нитрофенилфосфата 27
1.14 Механизмы окисления гиарохинонфосфоэфиров 32
1 2 Применение перфторированных арилазидов для фотоаффиниой модификации биополимеров 37
2 Результаты и их обсуждение 60
2 1 Механизм фотопревращения реагентов на основе л-азидофенилфосфата в условиях проведения фотоаффинной модификации биополимеров 60
2 1 1 Синтез и фотопревращение (3-(4-азидофенилового эфира)1ЮР при его облучении в водном растворе при рН 78
2 1 2 Фотопревращение л-азидофенил фосфата при его облучении в водном растворе при рН 51 62
2 1 3 Фотопревращение л-азидофенилфосфата при его облучении в водном растворе при рН 9 6 64
2.1 4 Фото превращение л-азидофенилфосфата при его облучении в водном растворе с 2,6-ксилолом 67
2 1 5. Фотопревращение я-азидофенилфосфата при его облучении в присутствии лизина 68
2 2. Фотовзаимодействие 4-азидо-2,3,5,6-тетрафторбензоильной группы с боковыми радикалами аминокислот в составе комплементарного комплекса 72
2 2.1 Получение фотоактивируємых производных олигонуклеотидов и конъюгатов олигонуклеотидов с соединениями, имитирующими функциональные группы белков 73
2 2 2 Внутрикомшіексное фотохимическое взаимодействие тетрафторазидобензоильной группы с боковыми радикалами аминокислот 78
2 3 Фотовзаимодействие 4-азидо-2,3,5,6-тетрафторбензоильной группы с боковыми радикалами ароматических аминокислот в модельных соединениях 81
23 1 Синтез производных ароматических аминокислот, несущих остаток 4-азидо-2,3,5,6-тетрафторбензойной кислоты 81
2 3 2 Фотовзаимодействие 4-азидо-2,3,5,б-тетрафторбензоильной группы с остатком тирозина 82
2,3 3 Фотовзаимодействие я-азидоперфторбензоильной группы с остатком триптофана 87
3 Экспериментальная часть 96
3 1 Материалы и методы 96
3 2 Компьютерное моделирование модельных соединений (80) - (82) 98
3 3 Синтез я-азидофенилфосфата 99
3 4 Синтез Р-(4-азидофенил)уридин-5-дифосфата (63) 99
3 5 Фотолиз и-азидофенилфосфата в карбонатном буферном растворе (рН = 9.6) 100
3 6 Выделение продуктов фотолитического разложения и-азидофенилфосфата в водном растворе (рН = 5.1) 100
3 7 Фотолиз й-азидофенилфосфата в присутствии лизина при рН 9 6 100
3 8 Синтез я-бензохинонмоноимина при рН 9 6 101
3 9. Фотолиз л-азидофе кил фосфата в водном растворе 2,6-ксилола 101
З.10 Получение цетавлоновой соли олигонуклеотидов 101
З.11 Получение фосфорилируюших производных моно- и олгонуклеотидов (77a)-(77sK)eDMF 101
3 12 Синтез 3-(3-аминопропил)-амидофосфата олигонуклеотида GGTATCp (74) 101
З 13 Синтез 3-(3-аминопропил)-&чидофосфата олигонуклеотида pGATACCAA 102
3 14 Синтез 3-[2-(2-аминоэтилдисульфанил)-этил]-амидофосфата олигонуклеотида GGTATCp (76) 102
3 15 Синтез 3-[3-(3-индолилацетиламидо)пропил]-амидофосфата олигонуклеотида GGTATCp (75) 102
3 16 Синтез 5-[3-(4-азидо-2,3,5,б-тетрафторбеизоиламидо)пропил]- амидофосфата олигонуклеотида pGATACCAA (73) 102
З.17 Внутридуплексная фотохимическая модификация 103
З 18. Синтез трет-бутилоксикарбоншіамино-(4-т/7іти-бутилкарбонилоксибензил)-уксусной кислоты (98) 103
3 19 Синтез jV-гидроксисукцинимидного эфира третбутилоксикарбониламино-(4-т/?ет-бутилкарбонилоксибензил)-уксусной кислоты (99) 103
3 20. Синтез ^-(3-аминопропил)-4-азидо-2,3,5,6-тетрафторбензамида (100) 104
3 21 Синтез /У-(2-аминоэтил)-4-азидо-2,3,5,б-тетрафторбензамида (Ю1) 104
3 22. Синтез #-(4-шинобутилН-азидо-2,3,5,6-тетрафтор-бенз&чида (102) 104
З 23 Синтез Д/-{2-[2-амино-3-(4-гидроксифенил)-пропиониламино]-зтил}-4- азидо-2,3,5,б-тетрафторбензамида(80) 104
З 24 Синтез ЛГ-{3-[2-амино-3-(4-гидроксифенил)-пропиониламино]-пропил}- 4-азидо-2,3,5,6-тетрафторбензамида(81) 104
З 25 Синтез Лг-{4-[2-ашно-3-(4-гидроксифенил)-пропиониламино]-бутил}- 4-азидо-2,3,5,6-тетрафторбензамида(82) 105
З 26 Синтез/У-{3-[2-амино-3-(1Я-шщол-3-ил)-пропиониламино]-пропил}-4- азидо-2,3,5,6-тетрафторбензамида(83) 105
З 27 Идентификация основных продуктов фотолиза соединений (80), (81), (82), (84) 105
Выводы 108
