Введение
Глава 1. Обзор литературы 13
1.1. Особенности строения и функции молочной железы в норме и при опухолеобразовании 13
1.2. Феномен метилирования ДНК и его вклад в развитие опухолей 17
1.3. Вклад нарушений метилирования ДНК в развитие РМЖ 19
1.4. Характеристики белков внеклеточного матрикса и трансмембранных клеточных рецепторов 1.4.1. Характеристика семейства белков ламининов 20
1.4.2. Характеристика семейства белков нидогенов 25
1.4.3. Характеристика семейства белков интегринов 29
1.4.4. Характеристика белка дистрогликана 35
1.4.5. Характеристика семейства белков кадгеринов 39
1.4.6. Характеристика семейств белков матриксных металлопротеиназ и их ингибиторов 45
Глава 2. Материалы и методы 53
2.1. Клинический материал 53
2.2. Выделение геномной ДНК 54
2.3. Обработка ДНК эндонуклеазами рестрикции 54
2.4. Метилчувствительная ПЦР 55
2.5. Электрофорез в ПААГ 61
2.6. Окрашивание ПААГ нитратом серебра 61
2.7. Выделение ДНК из полиакриламидных гелей 61
2.8. Обработка геномной ДНК бисульфитом натрия 61
2.9. Метил-специфическое секвенирование 62
2.10. Программное обеспечение 63
2.11. Статистическая обработка данных 63
Глава 3. Результаты и обсуждение 64
3.1. Изучение метилирования промоторных областей генов субъединиц ламининов 64
3.1.1. Гены ламининов, дифференциально метилированные при РМЖ 65
3.1.2. Гены ламининов, конститутивно метилированные в ткани молочной железы 71
3.2. Изучение метилирования промоторных областей генов нидогенов 74
3.3. Изучение метилирования промоторных областей генов субъединиц интегринов 77
3.4. Изучение метилирования промоторных областей генов кадгеринов 83
3.5. Изучение метилирования промоторных областей генов матриксных металлопротеиназ и их ингибиторов 88
3.6. Анализ метилирования изучаемых генов в клеточных линиях РМЖ 94
3.7. Поиск ассоциаций статуса метилирования генов и клинико-морфологических характеристик РМЖ 95
3.8. Комплексный анализ дифференциально метилированных генов 97
3.9. Формирование системы маркеров 104
Заключение 109
Выводы 111
Применение результатов и научных выводов 113
Список работ, опубликованных по теме диссертации 114
Список литературы 118
