Введение
Глава I. Обзор литературы 10
1. Методические подходы для анализа видового состава грибов 10
1.1. Морфологические методы анализа грибных патогенов 10
1.2. Молекулярные методы исследования видового состава грибных сообществ 13
1.3. Фитопатогенные грибы - возбудители заболеваний листьев пасленовых культур 28
1.4. Методы молекулярной диагностики фитопатогенных грибов 45
Глава II. Материалы и методы исследований 66
Часть III. Результаты и их обсуждение 85
Глава 3.1. Молекулярная идентификация видового состава грибов и грибоподобных организмов в пораженных растительных тканях 85
3.1.1. Рестрикционный анализ клонов 86
3.1.2. Исследование видового состава грибов и грибоподобных организмов в пораженных листьях Solanum tuberosum 90
3.1.3. Видовой состав грибов и грибоподобных организмов в пораженных листьях Solanum lycopersicum 97
3.1.4. Видовой состав грибов и грибоподобных организмов в пораженных листьях Solanum dulcamara 102
Глава 3.2. Конструирование тест-систем для идентификации видов рода Alternaria 115
3.2.1. Выделение изолятов Alternaria 116
3.2.2. Вирулентность штаммов Alternaria sp. к сортам картофеля и томата 116
3.2.3. Изучение активности сериновых протеиназ, секретируемых двумя различающимися по вирулентности штаммами A. alternata 120
3.2.4. Определение нуклеотидных последовательностей видов Alternaria 122
3.2.4.1. Анализ нуклеотидных последовательностей ядерных рибосомных генов 123
3.2.4.2. Анализ последовательности нуклеотидов участка гена mt LSU
рДНК 128
3.2.5. Подбор праймеров для идентификации видов Alternaria и проверка их видоспецифичности 130
3.2.6. Разработка диагностических систем для идентификации видов Alternaria с использованием ПЦР в реальном времени (РВ ПЦР) 133
4.1. Молекулярная идентификация видов Alternaria alternata и A. solani в пораженных листьях с использованием ПЦР в реальном времени 141
4.2. Молекулярная идентификация видов Alternaria в пораженных листьях методом классической ПЦР 147
4.3. Идентификация Colletotrichum coccodes с помощью ПЦР. 153
Заключение 157
Выводы 158
Научно - практические рекомендации 159
Благодарности 160
Список работ, опубликованных по теме диссертации 161
