Введение
Глава 1. Обзор литературы. Современные аспекты синэкологии симбиотических микроорганизмов толстой кишки человека и принципы коррекции микробиоты с помощью препаратов из штаммов-симбионтов 16
1.1. Видовая структура биотических сообществ 16
1.2. Симбиотические сообщества как объекты биоэкологических исследований 20
1.3. Роль микробиоты в процессе жизнедеятельности макроорганизма 24
1.4. Структурная организация микробиоценоза пищеварительного тракта 30
1.5. Функции нормальной микрофлоры пищеварительного тракта 33
1.6. Формирование микрофлоры у детей 35
1.7. Качественный и количественный состав нормальной микрофлоры ЖКТ 38
1.8. Дисбиоз кишечника 44
1.9. Средства коррекции микрофлоры 48
1.10. Молекулярно-биологические методы для индикации, идентификации пробиотических микроорганизмов и типирования промышленно-значимых штаммов 55
1.11. Современные принципы коррекции дисбиозов различных биотопов организма человека 62
Собственные исследования
Глава 2. Материалы и методы исследований 65
2.1. Дизайн исследования 65
2.2. Объем экспериментальных данных 66
2.3. Методы изучения видового состава и численности симбиотических микроорганизмов 69
2.3.1. Классические микробиологические методы 70
2.3.2. Методика молекулярно-генетического анализа 86
2.3.3. Метод экспертных оценок 89
2.3.4. Клинические методы исследований, использованные в работе для оценки эффективности пробиотиков 90
2.3.5. Методы статистического анализа 91
2.3.6. Методы ранговых распеределений 92
2.3.7. Методы экологического анализа 92
Глава 3. Синэкологический анализ симбиотичнской микробиоты толстой кишки людей разных возрастных групп 94
3.1. Выбор параметров оценки состояния микробиоценоза толстой кишки 95
3.2. Особенности возрастной динамики численности симбиотических микроорганизмов толстой кишки «здоровых» людей 103
3.2.1. Характеристика микрофлоры просвета толстой кишки «здоровых» детей 103
3.2.2. Характеристика микрофлоры просвета толстой кишки «здоровых» взрослых 120
3.3. Особенности возрастной динамики численности симбиотических микроорганизмов толстой кишки «больных» людей 130
3.4. Сравнение возрастной динамики численности симбиотических микроорганизмов толстой кишки «здоровых» и «больных» людей 134
3.4.1. Сравнительная характеристика микрофлоры просвета толстой кишки «здоровых» и «больных» детей 134
3.4.2. Сравнительная характеристика микрофлоры просвета толстой кишки «здоровых» и «больных» взрослых 154
3.5. Синэкологический анализ микробиоценозов толстой кишки «здоровых» и «больных» людей разных возрастных групп 166
3.5.1. Анализ ранговых распределений 167
3.5.2. Результаты кластеризации исходного массива данных бактериологических исследований 186
3.5.3. Результаты статистического анализа с использованием критериев Манна-Уитни и Краскала-Уоллиса 190
3.5.4. Анализ видового разнообразия 194
Глава 4. Теоретические и экспериментальные основы отбора производственных штаммов-продуцентов пробиотиков 202
4.1. Изучение биологических свойств штаммов-продуцентов пробиотиков 203
4.1.1. Определение антагонистической активности пробиотических штаммов лактобацилл 203
4.1.2. Изучение биосовместимости штаммов лактобацилл и бифидобактерий 211
4.1.3. Определение антагонистической активности лактобацилл к грибам рода Candida 221
4.1.4. Изучение выживаемости молочнокислых бактерий в кислой среде 223
4.1.5. Характеристика антибиотикорезистентности стартерных культур пробиотиков 224
4.2. Молекулярно-генетическая идентификация штаммов-продуцентов. 232
4.2.1. Разработка методики индикации бактерий рода Lactobacillus и Bifidobacterium на основе ПЦР гена 16S рРНК 233
4.2.2. Разработка методики видовой идентификации лактобацилл с использованием гнездового варианта ПЦР 241
4.2.3. Изучение динамики роста лактобацилл в аксеничной и смешанной культуре 245
4.2.4. Разработка алгоритма контроля динамики культивирования лактобацилл в смешанной культуре методом ПЦР 249
Глава 5. Конструирование новых жидких пробиотиков как средств коррекции микробной экосистемы человека 259
5.1. Конструирование и разработка технологии производства жидкого бактериального концентрата на основе лактобацилл «LL-комплекс» 261
5.2. Конструирование и разработка технологии производства пробиотика в форме БАД к пище на основе лакто-и бифидобактерий «LB-комплекс» 266
5.3. Конструирование и разработка технологии производства жидкого бактериального концентрата на основе лакто-и бифидобактерий «LB-комплекс S» 275 Глава 6. Бактериологическая и клиническая эффективность созданных жидких пробиотиков 281
6.1. Изучение эффективности включения синбиотика «LL-комплекс» в схемы лечения гастродуоденальной и аллергологической патологии у детей 281
6.2. Изучение эффективности включения синбиотика «LL-комплекс» в программы лечения воспалительных заболеваний органов малого таза (ВЗОМТ), осложненных кандидозом 285
6.3. Анализ результатов использования нового симбиотика «LB-комплекс» в лечебных программах выхаживания недоношенных новорожденных в педиатрическом стационаре 291
6.4. Эффективность включения пробиотиков «LB-комплекс» и «LL-комплекс» в программы оздоровления беременных женщин и детей на территории Г.Н.Новгорода 295
6.5. Эффективность использования пробиотика «LB-комплекс» в системе оздоровительно-реабилитационных мероприятий вДОУ 301
6.6. Оценка эффективности использования БАД к пище «LB-комплекс» в схемах антихеликобактерной терапии 304
6.7. Изучение эффективности включения симбиотика «LB-комплекс S» в алгоритм лечения туберкулезной инфекции у детей 314
6.8. Изучение эффективности использования симбиотика «LB-комплекс S» в программе оздоровления студентов старших курсов медицинского ВУЗа 320
Глава 7. Разработка алгоритма комплексной коррекции дисбиозной микробиоты желудочно-кишечного и репродуктивного тракта человека 325
Заключение 332
Выводы 338
Список цитированной литературы 341
