Введение
1. Обзор литературы 10
1.1 Оценка племенной ценности молочного скота 10
1.2 Математические подходы в прогнозировании племенной ценности животных 14
1.2.1 BLUP модели для осуществления прогноза геномной племенной ценнсти 14
1.2.2 Точность прогноза геномной племенной ценности 19
1.2.3 Референтная популяция 21
1.2.4 Заполнение (imputation) генотипов 22
1.3 Генетическая структура популяций 27
1.4. Геномная селекция в мировом животноводстве. Модели ГС 29
2. Материалы и методы исследования 35
3. Собственные исследования 45
3.1. Прогноз племенной ценности голштинского и черно-пестрого скота Ленинградской области с использованием модели BLUP 45
3.1.1 Формирование базы данных для прогноза племенной ценности 45
3.1.2 Разработка уравнения смешанной модели прогноза племенной цен ности животных с использованием методологии BLUP 61
3.1.3 Расчёт вариансы для определения коэффициента наследуемости и повторяемости анализируемой популяции скота 67
3.1.4 Расчет племенной ценности быков и коров с использованием разра-ботанной модели прогноза BLUP Animal Model 68
3.2. Молекулярно-генетический анализ популяционной структуры голштинского и черно-пестрого скота Ленинградской области 84
3.2.1 Создание репрезентативной выборки коров из популяции голштин ского и черно-пестрого скота Ленинградской области 84
3.2.2 Полногеномное SNP генотипирование коров репрезентативной выборки 87
3.2.3 Анализ гетерогенности популяции на основании реперезентативной выборки коров 91
3.3 Использование сформированной репрезенативной выборки для геномного прогноз племенной ценности животных голштинского и черно пестрого скота Ленинградской области. 101
3.3.1 Применение одношаговой модели оценки геномной племенной ценности с использованием родословной и геномной информации одновременно 101
3.3.2 Расчет геномной племенной ценности по признакам молочной продуктивности для генотипированных и BLUP оценки для негенотипированных животных 103
3.4 Требования к референтным популяциям 105
Заключение 106
Выводы 106
Практические предложения 108
Перспектива дальнейшей разработки темы 108
Список литературы 109
Приложение 126
