Введение
ГЛАВА 1. Обзор литературы 8
1.1. Биология, молекулярная эволюция и филогения осетровых рыб 8
1.1.1. Происхождение и разнообразие 8
1.1.2. Осетровые рыбы Амура 9
1.1.3. Полиплоидия 15
1.1.4. Межвидовая гибридизация 19
1.1.5. Филогенетика и систематика 25
1.1.6. Популяционная генетика 38
1.1.7. Гены ядерной 188рДНК 49
1.2. Краткая характеристика используемых методов и маркеров 60
1.2.1. Полимеразная цепная реакция и RAPD-анализ 60
1.2.2. Секвестрование ДНК 65
ГЛАВА 2. Материалы и методы 68
2.1. Получение геномной ДНК 69
2.2. RAPD-PCR анализ 69
2.3. PCR-амплификация ШрДНК 70
2.4. Клонирование 18SpHHK 71
2.5. Секвенирование последовательности 18S рДНК 74
2.6. Статистический анализ молекулярных данных 2.6.1. Обработка RAPD-данных 75
2.6.2. Обработка данных секвенирования 18S рДНК 78
2.6.3. Филогенетические реконструкции 81
2.6.4. Многомерное шкалирование (MDS) 83
2.6.5. Тесты для пседогенов 84
ГЛАВА 3. Результаты и обсуждение 90
3.1. Генетическое разнообразие и таксономическая идентификация осетровых рыб по данным изменчивости мультилокусных RAPD-маркеров з
3.1.1. Молекулярная идентификация и особенности генетического разнообразия межвидовых гибридов амурского осетра, полученных при искусственном скрещивании 91
3.1.2. Дискриминация межвидовых гибридов в природных популяциях осетровых рыб Амура 101
3.2. Молекулярная эволюция, генетическое разнообразие и филогенетические связи 18S рДНК 114
3.2.1. Генетическое разнообразие последовательностей 18S рДНК амурского осетра и калуги 116
3.2.2. Разнообразие последовательностей 18S рДНК у гибридов осетровых рыб 123
3.2.3. Филогенетический анализ 486 пн последовательностей 18S рДНК осетровых рыб: гены и псевдогены? 131
3.2.5. Филогенетические связи амурского осетра по данным полной последовательности 18S рДНК 149
Заключение 158
Выводы : 161
Список литературы
