Введение
Глава 1. Обзор литературы 11
1.2 Морфология центрохелидных солнечников 11
1.2.1 Внутренняя морфология клетки солнечников 12
1.2.2 Строение наружного скелета центрохелид 17
1.3 Физиология солнечников 20
1.3.1 Питание 20
1.3.2 Размножение и жизненный цикл солнечников 22
1.3.3 Движение и аксоподии 25
1.4 Экология центрохелидных солнечников 25
1.5 Биогеография и фауна солнечников 28
1.6 Филогения центрохелидных солнечников 34
1.7 Систематика и таксономия солнечников 36
Глава 2. Материалы и методы исследования 43
2.1 Характеристика исследуемых водоёмов и водотоков 43
2.1.1 Водоёмы и водотоки Заволжского региона 43
2.1.2 Водоёмы и водотоки Уральского региона 43
2.2 Методы отбора проб и культивирования солнечников 49
2.3 Микроскопические методы исследований солнечников 50
2.3.1 Световая микроскопия 50
2.3.2 Атомно-силовая микроскопия 50
2.3.3 Сканирующая электронная микроскопия 51
2.4 Идентификация и таксономия солнечников 51
2.5 Молекулярно-генетические методы изучения солнечников 52
2.5.1 Подготовка образцов для секвенирования по Сэнгеру 52
2.5.2 Подготовка образцов для метагеномного секвенирования 54
2.5.2.1 Подготовка и секвенирование природных образов 54
2.5.2.2 Подготовка и секвенирование накопительных культур 55
2.6 Биоинформатическая обработка и филогенетический анализ 57
Глава 3. Морфология и таксономия солнечников в континентальных водоёмах и водотоках степной и лесостепной зоны Заволжско-Уральского региона 59
3.1 Морфология центрохелидных солнечников 59
3.2 Heterophrys-подобные солнечники 79
3.3 Видовое богатство центрохелидных солнечников в биотопах с различной соленостью 80
Глава 4. Новые таксоны центрохелидных солнечников 87
4.1 Новый род и вид Pinjata ruminata gen. et sp. nov. 87
4.2.1 Виды Acanthocystis lyra sp. nov и Acanthocystis siemensmae sp. nov. 94
Глава 5. Применение новых методов для исследования морфологии и генетического разнообразия центрохелидных солнечников 107
5.1 Атомно-силовая микроскопия 108
5.2 Компьютерная программа для идентификации центрохелидных солнечников 114
5.3 Метабаркодинг солнечников в исследуемых водоёмах и водотоках 116
5.3.1 Оценка филогенетического положения выявленных ОТЕ 117
5.3.1.1 ОТЕ, группирующиеся на филогенетическом древе с известными таксонами центрохелид 117
5.3.1.2 ОТЕ, группирующиеся на филогенетическом древе с известными природными кладами центрохелид 120
5.3.2 Представители малоизученных линий солнечников 121
5.3.3 Краткая характеристика новых стеногалинных и эвригалинных линий центрохелид 123
Заключение 127
Выводы 147
Список сокращений и условных обозначений 149
Список литературы 150
