Введение
1. Обзор литературы 9
1.1. Клинико-морфологические особенности стромальных опухолей ЖКТ 9
1.1.1. Клиническая характеристика стромальных опухолей ЖКТ 10
1.1.2. Морфологическая характеристика стромальных опухолей ЖКТ 14
1.1.3. Иммуногистохимическаяхарактеристиха стромальных опухолей ЖКТ 18
1.1.4. Оценка риска злокачественности и прогностические факторы стромальных опухолей ЖКТ 24
1.2. Молекулярный патогенез стромальных опухолей ЖКТ 28
1.2.1. Общая характеристика мутаций генов c-Kit и PDGFRA 33
1.2.2. Первичные мутации гена c-Kit в стромальных опухолях ЖКТ 36
1.2.3. Первичные мутации гена PDGFRA в стромальных опухолях ЖКТ 41
1.3. Мутации и клинико-морфологические характеристики стромальных опухолей ЖКТ 44
1.4. Лечение стромальных опухолей ЖКТ 45
2. Материалы и методы 47
2.1. Общая характеристика материала 47
2.2. Методы исследования 49
2.2.1. Иммуногистохимическое исследование 49
2.2.2. Микродиссекция парафиновых срезов стромальных опухолей ЖКТ и выделение ДНК 52
2.2.3. Выделение геномной ДНК из операционных опухолевой ткани 53
2.2.4. Анализ мутаций в генах c-Kit и PDGFRA в стромальных опухолях ЖКТ 53
2.2.5. Разделение ПЦР-продуктов методом электрофореза в агарозном геле 56
2.2.6. Очистка ПЦР-продуктов для секвенирования 56
2.2.7. Анализ результатов прямого секвенирования 57
2.2.8. Статистическая обработка данных 57
2.2.9. Список используемых растворов 58
3. Результаты собственных исследований 59
3.1. Клинико-морфологическая характеристика GIST 59
3.2. Иммуногистохимическая характеристика стромальных опухолей ЖКТ74
3.3. Мутационный статус стромальных опухолей ЖКТ 80
3.3.1. Мутации гена c-Kit 80
3.3.2. Мутации гена PDGFRA 99
3.3.3. Стромальные опухоли ЖКТ дикого типа 101
4. Сопоставление молекулярно-генетических и клинико-морфологических параметров GIST 101
5. Обсуждение полученных результатов 116
Выводы 119
Список используемой литературы 121
