Введение
ГЛАВА 1. Обзор литературы 9
1.1. Типы и молекулярная структура мезогенов 9
1.1.1. Влияние химического строения молекул мезогенов на термотропный мезоморфизм 14
1.2. Методы компьютерного моделирования мезогенных соединений 17
1.2.1. Неэмпирические и полуэмпирические методы 17
1.2.2. Метод молекулярной динамики 18
1.2.2.1. Молекулярно-динамическое моделирование мезогенных соединений 20
1.3. Параллельные технологии в молекулярном моделировании 28
1.4. Исследования по разработке алгоритмов, пригодных для молекулярного моделирования 30
ГЛАВА 2. Материалы и методы исследования 34
2.1. Объекты исследования 34
2.1.1. 4-(транс-4 -пентилциклогексил)бензонитрил 34
2.1.2. 2,3,6,7,10,11-гексагептилокситрифенилен 35
2.1.3. 3,5-диамино-1-додецил-1,2,4-триазол и 3-амино-1,5-додецил-1,2,4-триазол, а также их бинарная система 36
2.2. Методы исследования 37
2.2.1. Квантово-химические расчеты 37
2.2.2. Метод молекулярной динамики 38
2.2.3. Средства параллельных технологий молекулярно-динамического моделирования 44
2.2.4. Обработка результатов моделирования 48
2.2.5. Метод поляризационной оптической микроскопи 49
ГЛАВА 3. Адаптация методик расчета ван-дер-ваальсовых взаимодействий для графических устройств с цельюисследования молекулярных систем 51
3.1. Разработка параллельных алгоритмов расчета ван-дер-ваальсовых взаимодействий для метода молекулярной динамики 51
3.2. Анализ эффективности методов расчета ван-дер-ваальсовых взаимодействий 53
3.3. Программный модуль «WDWForceCompMD» 64
3.4. Оценка корректности разработанных алгоритмов
3.4.1. Результаты МД-моделирования изотропной фазы бифенила 68
3.4.2. Результаты МД-моделирования изотропной фазы н-бутана 69
ГЛАВА 4. Исследование надмолекулярной организации и фазового состояния выбранных систем химических соединений 72
4.1. Исследование надмолекулярной организации и фазового состояния 4-(транс-4 -пентилциклогексил)бензонитрила 72
4.2. Исследование надмолекулярной организации и фазового состояния 2,3,6,7,10,11-гексагептилокситрифенилена 82
4.3. Исследование надмолекулярной организации и фазового состояния систем производных триазола 96
Заключение 105
Список сокращений 107
Список литературы 108
