Введение
Глава 1. Современная система классификации актиномицетов основывается на принципах полифазной таксономии 9
1.1. Фенотипические признаки, используемые для классификации и идентификации актиномицетов 11
1.2. Характеристики генома, используемые в классификации и идентификации актиномицетов 16
Глава 2. Систематика и экология актиномицетов семейства Microbacteriaceae 18
Глава 3. Актиномицетно-нематодные комплексы 32
3.1. Краткая характеристика нематод подсемейства Anguininae 32
3.2. Актиномицетно-нематодные комплексы 35
Экспериментальная часть
Глава 4. Материалы и методы 38
4.1. Объекты исследования 38
4.2. Обработка галлов и посев образцов 38
4.3. Изучение морфологических и культуральных признаков 38
4.4. Изучение физиолого-биохимических признаков 43
4.5. Изучение хемотаксономических признаков 44
4.6. Молекулярно-генетические методы 46
Результаты
Глава 5. Выделение микроорганизмов 48
Глава 6. Таксономическое изучение актиномицетов с диаминомасляной кислотой (ДАМК) в клеточной стенке 56
6.1. Штаммы ВКМ Ас-1401т, ВКМ Ас-1802 и близкие организмы 56
6.2. Штаммы ВКМ Ас-1390т и ВКМ Ас-1799т из галла на Festuca rubra 62
6.3. Штаммы из галлов на листьях Cousinia onopordioid.es, семенах Agrostis sp. и стеблях Elymus repens 64
6.4. Штаммы ВКМ Ас-1790 и ВКМ Ас-1792 из семенных галлов на Agrostis sp 66
6.5. Штамм ВКМ Ас-1800 из филлосферы Androsace sp 67
Глава 7. Таксономическое изучение актиномицетов, содержащих ДАМК и орнитин в клеточной стенке 68
Глава 8. Таксономическое изучение актиномицетов с орнитином в клеточной стенке 71
Глава 9. Таксономическое изучение актиномицетов с лизином в клеточной стенке 73
9.1. Штаммы ВКМ Ас-2059т и ВКМ Ас-2062 из семян рябчика русского и клематиса 73
9.2. Штамм ВКМ Ас-1396 из листового галла на Festuca rubra 74
Обсуждение результатов
Глава 10. Выделение и описания новых таксонов актиномицетов 75
10.1. Новый род Leifsonia и его видовой состав 75
10.2. Новый род Agreia и его видовой состав 83
10.3. Новый род Okibacterium и вид Okibacterium fritillariae 86
10.4. Новые виды Rathayibacter caricis и Rathayibacter festucae 90
10.5. Plantibacter agrosticola sp. nov., Plantibacter elymi sp. nov. и Plantibacter cousiniae sp. nov 94
10.6. Agromyces albus sp. nov 103
10.7. Curtobacterium calamagrosticola sp. nov 106
10.8. Frigoribacterium mesophilum sp. nov 108
Глава 11. Местообитание бактерий изученных таксонов и актиномицетно нематодные фитопатогенные комплексы 110
Заключение 118
Выводы 120
Литература 121
Список публикаций по теме диссертации. 137
