Введение
Глава 1. Обзор литературы 10
1.1 Типы взаимодействия различных лигандов с ДНК 10
1.1.1 Соединения, интеркалирующие между парами оснований ДНК 10
1.1.2 Соединения, локализующиеся при связывании в узкой бороздке ДНК 12
1.1.3 Соединения, локализующиеся при связывании в широкой бороздке ДНК 13
1.1.4 Соединения, ковалентно связывающиеся с ДНК 14
1.2 Катионные порфирины 14
1.2.1 Взаимодействие порфиринов с ДНК 15
1.3 Цианиновые красители 21
1.3.1 Взаимодействие цианиновых красителей с ДНК 23
1.3.2 Агрегация цианиновых красителей на матрице ДНК 24
1.3.3 SYBRGreen 1 25
1.4 Круговой дихроизм молекулярно организованных структур ДНК метод определения типа комплекса, образующегося между лигандом и
ДНК 27
1.4.1 Упорядочение низкомолекулярных двухцепочечных ДНК 27
1.4.2 Круговой дихроизм дисперсий нуклеиновых кислот 29
1.5 Наночастицы золота 32
1.5.1 Фотофизические свойства наночастиц золота 33
1.5.2 Взаимодействие наночастиц золота с ДНК 34
1.5.3 Взаимодействие наночастиц золота с флуорофорами 35
Глава 2. Материалы и методы 41
2.1 Материалы 41
2.1.1 Катионные производные тетрафенилпорфиринов 41
2.1.2 Цианиновые красители 41
2.1.3 Наночастицы золота з
2.1.4 Препараты ДНК 42
2.2 Методы 43
2.2.1 Спектрофотометрия и спектрофлуориметрия 43
2.2.2 Анизотропия флуоресценции 44
2.2.3 Метод однофотонного счета 45
2.2.4 Круговой дихроизм 46
Глава 3. Комплексообразование катионных тетрафенилпорфиринов с ДНК 47
3.1 Спектрофотометрическое исследование взаимодействия катионных производных тетрафенилпорфиринов с ДНК 47
3.2 Исследование взаимодействия производных катионных тетрафенилпорфиринов с ДНК методом кругового дихроизма 53
3.3 Определение типа комплекса, образуемого тетрафенилпорфиринами с ДНК в составе холестерической жидкокристаллической дисперсии, по спектрам кругового дихроизма 56
3.4 Времена жизни флуоресценции комплексов производных тетрафенилпорфиринов с молекулами ДНК 63
Глава 4. Исследование комплексов красителя цианинового ряда SYBRGreen I с ДНК 70
4.1 Концентрационное тушение красителя SYBRGreen І в комплексе с ДНК в растворе и в составе жидкокристаллических дисперсий ДНК 70
4.2 Деполяризация флуоресценции красителя SYBRGreen I доказательство миграции энергии между мономерами красителя, интеркалированными в ДНК 73
4.3 Анализ времен жизни флуоресценции красителя SYBRGreen I при концентрационном тушении в присутствии ДНК в растворе и в составе упорядоченных структур жидкокристаллических дисперсий 74
4.4 Исследование комплексообразования красителя SYBRGreen I с ДНК в составе холестерической жидкокристаллической дисперсии методом кругового дихроизма 78 4.5 Исследование образования ассоциатов красителя SYBRGreen І на матрице ДНК методом спектрофотометрии 80
Глава 5. Взаимодействие наночастиц золота с комплексами красителя SYBRGreen I и ДНК 84
5.1 Тушение флуоресценции органических красителей наночастицами золота на матрице ДНК 84
5.2 Супертушение флуоресценции красителя SYBRGreen I наночастицами золота на матрице ДНК в растворе 87
5.2.1 Модели взаимодействия красителя SYBRGreen I с наночастицами золота на матрице ДНК в растворе 88
5.2.2 Механизмы тушения флуоресценции красителя SYBRGreen I наночастицами золота на матрице ДНК 94
5.2.3 Анализ кинетических кривых уменьшения флуоресценции красителя SYBRGreen І в комплексе с ДНК в растворе под действием наночастиц золота 96
5.2.4 Образование ассоциатов наночастиц золота в присутствии комплекса красителя SYBRGreen I с ДНК 98
Выводы 101
Список литературы
