Введение
ГЛАВА 1 Обзор литературы 11
1.1 Систематическое положение морских окуней рода Sebastes 11
1.1.1 Исторические и современные представления о таксономическом статусе представителей рода Sebastes, обитающих в Северной Атлантике 13
1.1.2 Биологические и экологические особенности североатлантических Sebastes 16
1.1.3 Ареалы североатлантических Sebastes 22
1.1.4 Морфологическое разнообразие североатлантических Sebastes и их видовая идентификация 24
1.2 Генетические особенности североатлантических Sebastes 26
1.2.1 Изучение наследственно обусловленных физиологических и биохимических особенностей морских окуней 27
1.2.2 Аллозимный анализ 27
1.2.3 Изучение митохондриальной и ядерной ДНК 31
1.3 Изучение представителей североатлантических Sebastes неясного таксономического статуса 37
1.3.1 Морские окуни с промежуточными показателями диагностических признаков 37
1.3.2 «Окуни-гиганты» Северной Атлантики 40
1.3.3 Виды-двойники (криптические виды) морских окуней рода Sebastes 43
1.4 Современные представления о процессах видообразования у морских окуней рода Sebastes 46
1.4.1 Вклад процессов симпатрического и аллопатрического видообразования в становление самостоятельных видов рода Sebastes согласно современным представлениям. 46
1.4.2 Особенности видообразования североатлантических Sebastes 51
1.4.3 Нерешенные вопросы, касающиеся таксономического статуса, происхождения и популяционной структуры североатлантических Sebastes 54
ГЛАВА 2. Материалы и методы исследований 57
2.1 Отлов рыб и районы сбора материала 57
2.2 Методы биологического анализа 59
2.3 Методы гистологических исследований 61
2.4 Изучение дифференциации морских окуней по форме отолитов (shape analysis) 62
2.5 Методы аллозимного анализа 66
2.6 Методы анализа ДНК
2.6.1 Выделение тотальной клеточной ДНК 68
2.6.2 Полимеразная цепная реакция (ПЦР) 70
2.6.3 Рестриктный анализ 72
2.6.4 Электрофорез в агарозном геле 73
2.6.5 Электрофорез в полиакриламидном геле (ПААГ) 73
2.6.6 Регистрация и обработка результатов электрофореза 74
2.6.7 Секвенирование ПЦР-продуктов и анализ полученных сиквенсов з
2.6.8 Методы филогенетического анализа. Медианная сеть (MJ) гаплотипов (Network) 75
ГЛАВА 3. Генетическая дифференциация морских окуней рода sebastes северной атлантики и северного ледовитого океана, их происхождение и эволюция 78
3.1 Результаты изучения генетической дифференциации и генетического разнообразия
различных участков митохондриальной ДНК североатлантических Sebastes. 79
3.2 Тест-система для массового тестирования видовой принадлежности североатлантических Sebastes 83
3.3 Уточнение систематического положения морского окуня Белого моря 87
3.4 Реконструкция последовательности процессов видообразования у североатлантических
Sebastes 92
ГЛАВА 4. Особенности формирования современных ареалов североатлантических sebastes: на примере окуня-клювача 97
4.1 Разработка подходов для изучения внутривидовой структуры S. mentella Северной Атлантики и Северного Ледовитого океана 97
4.1.1 Тест-система на основе аллель-специфической ПЦР для тестирования принадлежности особей S. mentella к одной из двух филогенетических линий 98
4.1.2 Исследование формы отолитов у представителей двух филогенетических линий окуня-клювача 100
4.2 Пространственное распределение представителей окуня-клювача, принадлежащих к разным филогенетическим линиям 103
4.3 Результаты изучения разнообразия гаплотипов контрольного региона митохондриальной ДНК окуня-клювача 106
4.4 Реконструкция путей расселения североатлантических Sebastes в период формирования современных ареалов 110
ГЛАВА 5. Современные генетические процессы в популяциях морских окуней: на примере межвидовой гибридизации 113
5.1 Гибридизация S. mentella моря Ирмингера с другими видами морских окуней 114
5.2 Гибриды среди особей с морфологическими особенностями. «Окуни-гиганты» 120
5.3 Физиологические особенности гибридов. Состояние гонад 127
5.4 Гибридизация североатлантических Sebastes и ее влияние на генофонд популяций
морских окуней 131
Заключение 135
Выводы 138
Список литературы 140
