Введение
Глава 1. Изучение эволюционной истории видов растений с помощью генетических маркеров 10
1.1. Послеледниковая реколонизация Северной Евразии лесными видами и её генетические эффекты 10
1.2. Популяционные эффекты гибридизации у растений и их изучение. 17
1.3. Молекулярные маркеры, используемые в популяционно- генетических и филогенетических исследованиях растений 20
Глава 2. Виды larix и изучение их изменчивости 41
2.1. Ареалы и систематика лиственниц 41
2.2. Геологическая история лиственниц 44
2.3. Фенотипическая изменчивость лиственниц 49
2.4. Изучение генетической изменчивости лиственниц с применением молекулярных и кариологических методов 50
Глава 3. Материалы и методы 55
3.1. Материалы и методы, использованные при изучении генетической изменчивости видов Larix с помощью аллозимного анализа 55
3.2. Материалы и методы, использованные при изучении генетической изменчивости видов Larix на видовом уровне с помощью анализа ДНК 62
3.2.1. Материалы и методы, использованные в анализе генетической изменчивости с помощью AFLP 65
3.2.2. Материалы и методы, использованные в анализе изменчивости хлоропластной ДНК с помощью микросателлитных локусов 66
3.2.3. Методы, использованные в анализе изменчивости митохондриальной ДНК с помощью методик Саузерн-блот и ПЦР-
ПДРФ 69
3.2.4. Материалы и методы, использованные при изучении структуры популяций лиственницы сибирской с помощью анализа изменчивости митохондриальной ДНК (посредством вновь разработанных маркеров) 72
3.3 Материалы и методы, использованные в анализе филогении видов Larix 81
Глава 4. Внутри - и межвидовая структура генетической изменчивости ядерного, хлоропластного и митохондриального геномов лиственниц северной евразии и северной америки, её связь с прошлой и современной динамикой популяций 90
4.1. Структура изменчивости ядерных ко доминантных маркеров (аллозимные локусы) видов Larix 91
4.2. Анализ генетической изменчивости видов Larix с помощью маркеров AFLP 111
4.3. Результаты изучения изменчивости хлоропластной ДНК с помощью микросателлитных локусов 120
4.4. Результаты анализа изменчивости митохондриальной ДНК в популяциях североевроазиатских видов Larix, проведенного с использованием методик Саузерн-блот и ГЩР-ПДРФ. Сравнение с данными по хлоропластному и ядерному геномам 129
Глава 5. Структура изменчивости митохондриальной днк и послеледниковая история лиственницы сибирской (larixsibiricaledeb.) 155
5.1. Генетическая изменчивость 155
5.2. Изменчивость в маргинальных популяциях 161
5.3. Пространственное распределение гаплотипов внутри популяции... 162
5.4. Географическое распределение гаплотипов и историко-
географические интерпретации 162
Глава 6. Реконструкция филогении видов larix на основе изменчивости хлоропластной и ядерной ДНК . 177
6.1. Результаты 180
6.1.1. Изменчивость хлоропластной ДНК 180
6.1.2. Реконструкция филогении на основании изменчивости фрагментов AFLP 183
6.2. Обсуждение 184
Заключение и основные выводы 193
Литература 198
Приложение 237
