Введение
ГЛАВА 1. Обзор литературы 12
1.1. Физико-химическая характеристика поверхностного микрослоя воды 12
1.1.1.Толщина поверхностного микрослоя воды 12
1.1.2. Состав и структура поверхностного микрослоя воды 17
1.1.3. Роль поверхностного микрослоя воды в газообмене 21
1.2. Методы отбора проб поверхностного микрослоя воды 22
1.2.1. Устройства для отбора проб поверхностного микрослоя воды 22
1.2.2. Сравнение различных методик пробоотбора 25
1.3. Эколого-биологические особенности поверхностного микрослоя воды 28
1.3.1. Методы изучения микробных сообществ поверхностного микрослоя воды 29
1.3.2. Разница в составе, численности и активности микробных сообществ поверхностного микрослоя и подповерхностного слоя воды 31
1.3.3. Фитонейстон 34
1.4. Роль микроорганизмов в функционировании экосистемы поверхностного микрослоя воды 35
1.4.1. Участие микробных сообществ поверхностного микрослоя воды в газообмене 36
1.4.2. Адаптация микробных сообществ поверхностного микрослоя воды к УФ излучению 38
1.5. Эколого-географическая характеристика озера Байкал 41
ГЛАВА 2. Объекты и методы исследования 44
2.1. Объекты исследования и отбор проб поверхностного микрослоя воды 44
2.2. Культивирование гетеротрофных бактерий 47
2.3. Изучение морфологических признаков гетеротрофных бактерий.. 47
2.3.1. Световая и эпифлюоресцентная микроскопия 47
2.4. Изучение физиолого-биохимических признаков гетеротрофных бактерий 48
2.4.1. Изучение способности бактерий утилизировать моно- и дисахариды, спирты, аминокислоты 48
2.4.2. Определение активности внеклеточных ферментов 49
2.5. Молекулярно-генетические методы исследования микробных сообществ поверхностного микрослоя воды 51
2.5.1. Выделение геномной ДНК 51
2.5.2. Полимеразная цепная реакция 52
2.5.3. Секвенирование по Сэнгеру и филогенетический анализ 52
2.5.4. Метагеномный анализ ампликонов. 53
2.6. Биоинформационный анализ и статистическая обработка данных 54
ГЛАВА 3. Пространственное распределение и основные факторы, влияющие на численность бактерий в поверхностном микрослое воды озера Байкал 56
3.1. Адаптация методов отбора проб поверхностного микрослоя воды в условиях озера Байкал 56
3.1.1. Оценка толщины забираемого поверхностного микрослоя воды с помощью разного инструментария для пробоотбора 56
3.1.2. Количественная характеристика бактериальных сообществ поверхностного микрослоя воды озера Байкал при отборе проб сеткой и фильтрами 58
3.2. Распределение общей численности бактерий и численности культивируемых гетеротрофных бактерий в поверхностном микрослое и подповерхностном слое воды озера Байкал 60
3.3. Влияние физических факторов на численость бактерий в поверхностном микрослое и подповерхностном слое воды озера Байкал 66
3.4. Физико-химические особенности поверхностного микрослоя воды озера Байкал 69
ГЛАВА 4. Таксономический состав микробных сообществ поверхностного микрослоя воды озера байкал по данным пиросеквенирования 73
4.1. Состав бактериальных сообществ поверхностного микрослоя воды озера Байкал в весенний и летний периоды 73
4.2. Эукариоты поверхностного микрослоя воды озера Байкал, детектированные по последовательностям гена 16S рДНК хлоропластов 94
ГЛАВА 5. Физиолого-биохимические свойства бактерий поверхностного микрослоя воды озера байкал 97
5.1. Разнообразие и физиолого-биохимические свойства гетеротрофных бактерий, выделенных из поверхностного микрослоя воды озера Байкал 97
5.2. Ферментативная активность бактериальных сообществ поверхностного микрослоя озера Байкал 107
Заключение 110
Выводы 113
Список литературы
