Введение
ЧАСТЬ 1. Обзор литературы 9
1.1. Рибосомные РНК и гены, их кодирующие 9
1.2. Структурно-функциональная организация МГС 12
1.3. Субповторы МГС 12
1.4. Функция субповторов 17
1.5. Промоторы генов рРНК 19
1.6. Проксимальный терминатор генов рРНК 21
1.7. Регуляция транскрипции генов рРНК 22
1.8. Метилирование цитозиновых остатков в CG и CNG последовательностях
1.9. Филогенетические взаимоотношения в трибе пшеницевых 34
ЧАСТЬ 2. Объекты и методы исследований 39
2.1. Выделение и очистка ДНК растений 39
2.2. Выделение и очистка плазмидной ДНК 40
2.3. Обработка ДНК метабисульфитом натрия 42
2.4. Получение одноцепочечной ДНК 43
2.5. Расщепление ДНК рестриктазами 44
2.6. Электрофорез фрагментов ДНК в агарозных гелях 44
2.7. Элюция фрагментов ДНК из агарозного геля 45
2.8. Полимеразная цепная реакция 46
2.9. Олигонуклеотидные праймеры, использованные в ПЦР 47
2.10. Лигирование векторной ДНК с амплифицированной ДНК 47
2.11. Подготовка компетентных клеток E.coli 48
2.12. Трансформация компетентных клеток E.coli плазмидной ДНК 49
2.13. Секвенирование ДНК ферментативным методом 49
2.14. Электрофоретическое фракционирование ДНК в денатурирующих условиях (секвенирующий гель-электрофорез)
2.15. Выявление полиморфизма однонитчатых цепей ДНК 52
2.16. Компьютерный анализ нуклеотидных последовательностей 53
2.17. Бактериальные штамы 53
2.18. Реактивы и материалы 54
2.19. Составы использованных стандартных растворов 55
ЧАСТЬ 3. Результаты исследования 56
3.1 .Выяыление промоторов генов рРНК, присущих геномам А у ди и полиплоидных пшениц
3.2. Нуклеотидные последовательности участков МГС рДНК диплоидной пшеницы Triticum sinskajae генома А, тетраплоидной пшеницы T.timopheevii (субгеномы А и G) эгилопсов предполагаемых доноров субгеномов В, G и D 57
3.3. Нуклеотидные последовательности МГС рДНК субгенома AT. 71
aestivum и генома А Т. urartu после обработки растений 6- бензиламинопурином и дезаминирования ДНК при помощи метабисульфита натрия
ЧАСТЬ 4. Обсуждение результатов 80
4.1. Эволюция промоторных областей МГС рДНК пшеницевых 80
4.2. Установление филогенетических взаимоотношений в пшенично-эгилопсном альянсе путем сравнения нуклеотидных последовательностей промоторных областей МГС рДНК
4.3. Метилирование цитозиновых остатков промоторных областей 97
МГС рДНК субгенома А Т. aestivum и Т. urartu после обработки
растений 6-бензиламинопурином.
Выводы 104
Список литературы 106
