Введение
Глава 1 Обзор литературы. Видовая идентификация микроорганизмов: теоретические и прикладные аспекты 8
1.1 Современные представления о таксономии и номенклатуре микроорганизмов (на примере представителей рода Staphylococcus) и методы их видовой идентификации . 8
1.2 Вероятностно-статистические методы, применяемые для целей межвидовой дифференциации микроорганизмов. 13
1.3 Практические аспекты видовой идентификации микроорганизмов при оценке биологического разнообразия риродных экосистем. 29
Глава 2 Объекты и методы исследования 37
2.1 Объекты исследования - микроорганизмы рода Staphylococcus и методы их выделения . 37
2.2 Методы видовой идентификации стафилококков 39
2.3 Методы математического анализа и программирования. 42
Глава 3 Обоснование использования метода кластерного анализа для целей межвидовой дифференциации и его использование при разработке "Универсальной программы для видовой идентификации микроорганизмов".51
3.1 Сравнительный анализ результатов дифференциации, полученных методами корреляционного, дискриминантного анализа и кластерного анализа. 51
3.2 Использование метода кластерного анализа при разработке «Универсальной программы для видовой идентификации микроорганизмов». 57
Глава 4 Анализ диагностической эффективности различных тест систем с использованием разработанной универсальной компьютерной программы для видовой идентификации стафилококков. АЛ Анализ диагностической эффективности тест-системы 70 ПБДС (пластина биохимическая дифференцирующая стафилококки), производимой НПО «Диагностические системы» (Нижний Новгород, Россия). - 69
4.2 Анализ диагностической эффективности тест-систем для 73 идентификации стафилококков «STAPHYtest-8» и ««STAPHYtest-16» (Lachema, Чехия).
4.3 Анализ диагностической эффективности тест-систем API- 81 Staph и ID32(«bioMerieux», Франция).
Глава 5 Оценка биологического разнообразия стафилококков для оценки техногенного воздействия на природные экосистемы. 88
Заключение 96
Список использованных источников 106
Приложение А 117
Приложение Б 118
