Введение
1. Моделирование строения, спектров и динамики молекул в инертных матрицах
1.1. Строение, спектры и динамика кластеров металлов в матрицах инертных газов 14
1.2. Малые молекулы и межмолекулярные комплексы в матрицах инертных газов 34
1.3. Моделирование спектров молекул в матрицах методами смешанной квантово-классической молекулярной динамики 45
2. Развитие метода двухатомных фрагментов в молекулах (ДФМ) для моделирования свойств межмолекулярных кластеров с водородными связями 64
2.1. Модель ДФМ для потециалыюй поверхности молекулы воды 67
2.2. Развитие модели ДФМ, и строение кластеров (Н20) 71
2.3. Развитие модели ДФМ, и строение кластеров (HF) 78
2.4. Комбинированный метод КМ/ДФМ: Диссоциация молекулы HF в кластерах (HF) 88
3. Развитие комбинированных методов квантовой и молекулярной механики (КМ/ММ) для моделирования химических реакций в сложном молекулярном окружении 106
3.1. Моделирование реакции ОН" + С02 —> НС03" в водных кластерах 110
3.2. Реакция глютатиона с гидроксиметильным радикалом в водных кластерах 113
3.3. Моделирование свойств и динамики НХеОН в водных кластерах 132
3.4. Метод КМ/ММ с конформационно-подвижными эффективными фрагментами. 135
3.5. Моделирование протонного транспорта по водным проводам 141
3.6. Моделирование механизмов ферментативных реакций 146
Основные результаты и выводы 165
