Введение
Глава 1 Обзор литературы 12
1.1. Эпидемиология почечно-клеточной карциномы 12
1.1.1 Классификация почечно-клеточных карцином 13
1.1.2 Этиология почечно-клеточных карцином 18
1.2 МикроРНК – эпигенетические регуляторы экспрессии генов 23
1.2.1 Секреторные микроРНК 23
1.2.2 Стабильность микроРНК 24
1.2.3 МикроРНК как биомаркеры при онкологических заболеваниях 25
1.2.4 Участие микроРНК в развитии почечно-клеточных карцином 30
Глава 2. Материалы и методы исследования 34
2.1 Материалы исследования 34
2.2 Молекулярно-генетические методы исследования 36
2.2.1 Забор образцов периферической крови и биопсии 36
2.2.2 Выделение геномной ДНК и тотальной РНК 36
2.2.3 Анализ экспрессии генов микроРНК с использованием технологии OpenArray чипа на приборе Quant Studio12K Flex Realime PCR System 37
2.2.4 Метилчувствительная ПЦР с использованием набора EpiTect Methyl II PCR Array 42
2.2.5 Анализ ассоциаций полиморфных вариантов генов биогенеза и предшественников микроРНК с использованием технологии OpenArray чипа на приборе Quant Studio12K Flex Realime PCR System 43
2.2.6 Метод дискриминации аллелей TaqMan 44
2.2.7 Статистическая обработка результатов 45
2.2.8 Дизайн исследования 47
Глава 3. Результаты и обсуждение 52
3.1 Анализ экспрессии 758 генов микроРНК в опухолевой ткани почки и нормальной почечной паренхиме пациентов со светлоклеточным раком почки 52
3.2 Анализ метилирования 22 генов микроРНК в опухолевой ткани почки и нормальной почечной паренхиме пациентов со светлоклеточным раком почки 59
3.3 Анализ ассоциации генотипов и аллелей полиморфных вариантов генов биогенеза и предшественников микроРНК с риском развития почечно-клеточных карцином 68
3.4 Анализ ассоциации генотипов и аллелей полиморфных вариантов в сайтах связывания микроРНК генов VHL-HIF-зависимого пути с риском развития почечно-клеточных карцином 88
3.5 Анализ ассоциаций сочетаний аллелей и генотипов полиморфных вариантов генов биогенеза и предшественников микроРНК и полиморфных вариантов сайтов связывания микроРНК генов VHL-HIF1-зависимого пути с риском развития светлоклеточного рака почки 93
Заключение 98
Выводы 103
Список сокращений и условных обозначений 105
Список литературы 106
Приложение А – Характеристика пациентов и индивидов из контрольной группы, включенных в исследование 126
Приложение Б – Результаты анализа экспрессии генов микроРНК 131
Приложение В – Распределение частот генотипов и аллелей полиморфных локусов генов биогенеза и предшественников микроРНК 132
Приложение Г – Распределение частот генотипов и аллелей полиморфных локусов, располагающихся в сайтах связывания микроРНК генов VHL-HIF-зависимого пути 152
