Введение
ГЛАВА 1. Обзор литературы 13
1.1. Микрофлора кишечного тракта рыб 14
1.1.1. Разнообразие кишечной микрофлоры рыб 15
1.1.2. Роль симбионтной микрофлоры, населяющей кишечный тракт рыб 22
1.1.3. Микроорганизмы с неустановленным функциональным значением 24
1.2. Микроорганизмы - возбудители инфекционных заболеваний
внешних покровов рыб 30
1.2.1. Инфекционные заболевания рыб Байкала и озёр Забайкалья 31
1.2.2. Сочетанные инфекции внешних покровов рыб 33
1.3. Особенности экологии лососевидных рыб 37
ГЛАВА 2. Объекты и методы исследований 43
2.1. Характеристика объектов исследования и пробоподготовка 43
2.2. Методы исследования
2.2.1. Молекулярно-генетические методы 45
2.2.2. Методы микроскопического анализа 55
2.2.3. Культивирование на селективных питательных средах 56
2.2.4. Серологические методы 58
ГЛАВА 3. Таксономическое разнообразие кишечной микрофлоры байкальского омуля и хариуса (thymallus) 60
3.1. Разнообразие кишечной микрофлоры байкальского омуля 61
3.2. Разнообразие кишечной микрофлоры рыб рода Thymallus 65
3.3. Сравнительная характеристика кишечной микрофлоры лососевидных рыб 72
ГЛАВА 4. Микоплазмы - специфичные представители микрофлоры рыб рода thymallus 76
4.1. Детекция и распространение генотипа Mycoplasma 76
4.2. Филогенетический анализ генотипа Mycoplasma 78
4.3. Культуральные и морфологические особенности Mycoplasma 83
4.4. Количественная оценка распределения байкальского генотипа Mycoplasma 87
ГЛАВА 5. Молекулярно-генетические исследования состава сообществ микроорганизмов, ассоциированньіх с язвенными поражениями внешних покровов рыб 90
5.1. Сообщества микроорганизмов язв рыб в аквариумных экспозициях 90
5.2. Сообщества микроорганизмов язв рыб озера Байкал 92
5.3. Сообщества микроорганизмов язв рыб озера Арахлей 95
Заключение 98
Выводы 100
Список литературы
