Введение
Глава 1 Обзор литературы 8
1.1 Взаимодействие ДНК с пептидами и белками 8
1.1.1 Структурные характеристики ДНК 17
1.1.2 Механизмы распознавания сайтов связывания на ДНК белками 21
1.1.3 Сайт-специфическое взаимодействие белков с ДНК по большой бороздке 25
1.1.4 Сайт-специфическое взаимодействие белков с ДНК по малой бороздке 27
1.2 Взаимодействие ДНК с короткими пептидами 28
1.2.1 Виды биологически активных пептидов 28
1.2.2 Способы пептидов проникать через клеточную и ядерные мембраны 37
1.2.3 Возможные механизмы взаимодействия коротких пептидов с молекулой ДНК 38
1.3 Связывание ДНК с различными аминокислотами 40
Глава 2 Материалы и методы исследования 46
2.1 Материалы 46
2.2 Методы исследования 48
2.2.1 Некоторые сведения из статистики биополимеров 48
2.2.2 УФ-спектрофотометрия 53
2.2.3 Метод кругового дихроизма 55
2.2.4 Плавление ДНК 56
2.2.5 Низкоградиентная вискозиметрия 56
2.2.6 Люминесценция 57
2.2.7 Изотермическое калориметрическое титрование 59
2.2.8 Ядерно-магнитный резонанс. WaterLOGSY 61
2.2.9 Динамическое двойное лучепреломление 65
Глава 3 Результаты и их обсуждение 68
3.1 Исследование взаимодействия пептида AEDG с ДНК 69
3.2 Исследование взаимодействия пептида AEDL с ДНК 76
3.3 Исследование взаимодействия пептида EDR с ДНК 87
3.4 Исследование взаимодействия пептида KEDW с ДНК 98
3.5 Ядерный магнитный резонанс систем ДНК-пептиды. Метод WaterLOGSY 106
Заключение 113
Выводы 116
Перечень условных обозначений и сокращений 117
Список терминов 119
Благодарности 120
Список литературы 121
