Введение
2. Обзор литературы
2.1. Основные классы ДНК-зависимых РНКП 6
2.2. Бактериальная ДНК-зависимая РНКП 9
2.3. Рентгеноструктурный анализ бактериальной РНКП 13
2.4. Модель элонгационного комплекса бактериальной РНКП 17
2.5. Каталитические активности бактериальной РНКП
2.5.1. Структура активного центра РНКП 21
2.5.2. Цикл добавления нуклеотида. Конформационные состояния активного центра РНКП 23
2.5.3. Структурные элементы активного центра, вовлеченные в транслокацию 25
2.6. Конформационная динамика активного центра РНКП в ЭК
2.6.1. ТранслокацияРНКПи ее возлюжныемеханимы 27
2.6.2. Механизм транслокации для бактериального ЭК
по модели «Броуновского храповика» 32
2.7. Механизмы загрузки субстрата в активный центр РНКП 35
2.8. Точность РНКП в процессе транскрипции 37
3. Результаты и обсуждение
3.1. Получение и характеристика элонгационных комплексов, имеющих определенное конформационное состояние 43
3.2. Механизм ингибирующего действия антибиотика стрептолидигина 59
3.3. Механизм ошибочного включения нуклеотида в транскрипт, обусловленного «выпетливанием» транскрибируемой цепи ДНК в области активного центра 66
3.4. Определение участка плавления ДНК дуплекса. в области активного центра бактериальной РНКП 78
4. Материалы и методы
4.1. Материалы и реагенты 87
4.2. Методы 96
Выводы 112
Сокращения и обозначения 113
Список литературы 115
