Введение
ГЛАВА 1. ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ
1.1. Лимнологические характеристики озера Байкал, обусловливающие особенности функционирования водной экосистемы 8
1.2. Развитие микробиологических исследований озера Байкал 9
1.3. Молекулярно-биологические методы в изучении состава и структуры микробных сообществ 13
ГЛАВА 2. МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ ИССЛЕДОВАНИЙ
2.1. Методы 29
2.2. Состав буферов и сред, использованных в работе 40
ГЛАВА 3. РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ 44
3.1. Количественный анализ таксономического состава водного микробного сообщества озера Байкал 45
3.2. Изучение филогенетического разнообразия некультивируемых глубоководных микроорганизмов озера Байкал 53
3.3. Сопоставление результатов идентификации культивируемых гетеротрофных бактерий по морфо-биохимическим тестам и секвенированию гена 16S рРНК 67
ЗАКЛЮЧЕНИЕ 78
ВЫВОДЫ 81
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ 84
ПРИЛОЖЕНИЕ 99
СПИСОК СОКРАЩЕНИЙ
АТФ - аденозин трифосфат
ДАФИ - 4,6-диамидино-2-фенилиндол
ддНТФ - дидезоксинуклеотид трифосфаты
ДДТ - дитиотрейтол
ДМСО - диметилсульфоксид :
ДНК - дезоксирибонуклеиновая кислота
дНТФ - дезоксинуклеотид трифосфаты
ед.акт. - единицы активности !
КОЕ - колониеобразующая единица
п.н. - пара нуклеотидов
ПФА - параф ормальдегид
ПЦР — полимеразная цепная реакция
РИА - рыбо-пептонный агар |
рРНК - рибосомальная рибонуклеиновая кислота
трис-НС1 - трис-оксиметиламцнометана гидрохлорид
ЭДТА - этилендиаминтетрауксусная кислота
K-MES - 2|Тч[-морфолино]этанрульфонат калия
PBS - фосфатный буфер
SDS - додецилсульфат натрия
Taq ДНК-полимераза - термофильная ДНК-полимераза Thermus aquaticus
X-gal - 5-бромо-4-хлоро-3-индолил-(3-0-галактопиранозид
