Введение
ГЛАВА 1. Почва как биотоп для выживания патогенных бактерий
1.1. Роль почвы в возникновении эпидемий 10-14
1.2. Патогенные бактерии, обнаруживаемые в почвах 15-18
1.3. Факторы, определяющие выживаемость патогенных микроорганизмов в почвах 18
1.4. Coxiella burnetii и Q-лихорадка 25-31
1.5. Свободноживущие амебы и потенциально патогенные микроорганизмы 31
ГЛАВА 2. Объекты и методы исследования 36-53
2.1. Структура исследования (модель экспериментов) 36-39
2.1.1. Определение выживаемости Coxiella burnetii в почвах 36-38
2.1.2. Обнаружение амебо-резистентных бактерий (АРБ) в почвах 38
2.2. Объекты исследования 40-42
2.2.1. Почвы, используемые для определения выживаемости Coxiella burnetii 40
2.2.2. Почвы, используемые для обнаружения АРБ 41 -42
2.3. Методы исследования 42-53
2.3.1. Методика почвенных исследований 42-44
2.3.2. Иммунофлуоресцентный анализ 44
2.3.3. Co-культура амеб 45-53
2.3.3.1. Подготовка образцов. «Российская» и «французская» методики 45
2.3.3.2. Инокуляция образцов в культуру амеб 46-47
2.3.3.3. Наблюдение за со-культурой 48
2.3.3.4. Выделение и морфологическая идентификация штаммов
2.3.3.5. Цитопатогенный эффект 49-50
2.3.3.6. Клонирование 50-52
2.3.3.7. Молекулярная идентификация изолятов 52-53
ГЛАВА 3. Выживаемость coxiella burnetii почвах
3.1. Выживаемость С. burnetii в почвах различных типов 54-55
3.2. Влияние свойств почв на выживаемость С. burnetii 56-58
ГЛАВА 4. Использование амеб для обнаружения потенциально патогенных бактерий в почвах
4.1. Разнообразие амебо-резистентных бактерий (АРБ) в почвах 59
4.2. Лизис амеб и цитопатогенные свойства изолятов 60-61
4.3. Идентификация изолятов 61 -63
4.4. Выделение нового вида 63-64
4.5. Удельная поверхность почвы и адгезия бактерий (сравнение методик) 65
ГЛАВА 5. Особенности выживания патогенных бактерий в почвах (обсуждение результатов) 72
Заключение 83-85
Выводы 86-87
Список литературы 88-102
