Введение
Глава 1. Современное состояние в области создания количественных моделей «структура – свойство» и «структура – активность» (на примере острой токсичности органических соединений) .13
1.1. Общая схема QSPR/QSAR моделирования 13
1.2. Объекты исследования и источники данных .15
1.3. Дескрипторы .19
1.4. Кластеризация молекул. Предобработка данных 22
1.5. Отбор дескрипторов .26
1.6. Статистические методы моделирования .28
1.7. Валидация моделей .33
1.8. Модели 39
1.9. Экспертные системы 73 Выводы по главе 76
Глава 2. Экспериментальная часть .78
2.1. Физико-химические данные .78
2.2. Биологические данные 78
2.3. Расчет, преобразование и отбор дескрипторов 79
2.4. Меры сходства химических соединений 81
2.5. Статистические методы исследования 82
2.6. Валидация QSPR/QSAR моделей .84
2.7. Методика проведения спектральных и калориметрических измерений .87
2.8. Планирование эксперимента и оценка термодинамических параметров водородной связи по данным экспериментальных измерений 88
2.9. Исходные вещества, реактивы и их квалификация .90
Глава 3. Количественные модели «структура – физико-химические свойства» органических соединений 91
3.1. Аддитивно-мультипликативная модель энтальпии и свободной энергии
6 водородной связи. Монофункциональные соединения .91
3.2. Аддитивно-мультипликативная модель энтальпии и свободной энергии водородной связи. Полифункциональные соединения .116
3.3. Модель липофильности органических соединений 122
3.4. Компьютерный программный комплекс HYBOT 134 Выводы по главе 140
Глава 4. Количественные локальные модели «структура – биологическая активность» органических соединений .142
4.1. Классификационные и регрессионные модели неполярного наркоза .142
4.2. Классификационные и регрессионные модели полярного наркоза .157
4.3. Линейный дискриминантно - регрессионный подход .182
4.4. Ретардантная активность солей четвертичного аммония 191 Выводы по главе 195 Глава CLASS 5. Количественные глобальные модели «структура – биологическая активность» органических соединений 197 CLASS
5.1. Модель AЛБT .197
5.2. Модель AMP 213
5.3. Модель ЛРМПК 225
5.4. Проницаемость ФАВ через гематоэнцефалический барьер .233 Выводы по главе 238 CLASS Глава 6. Перспективные разработки в области создания количественных моделей «структура – свойство» и «структура – активность» .240 CLASS
6.1. Рекуррентная модель .240
6.2. Фрактальный дескриптор 251
6.3. Линейная динамическая модель 265 Выводы по главе 277 Заключение 278 Список литературы 280
