Введение
Глава I. Особенности биологии аэробных метилобактерий 9
1.1. Общая характеристика и таксономия 9
1.2. Особенности метаболизма 18
1.3. Экология аэробных метилобактерий и их роль в природе 23
1.4. Биотехнологический потенциал аэробных метилобактерий 25
Глава II. Гало(алкало)фильные микроорганизмы 26
2.1. Физиологические особенности 26
2.2. Содовые озера - источник галоалкалофильных микроорганизмов 27
2.3. Мраморные памятники как источники галоалкалофильных микроорганизмов 28
2.4. Стратегии адаптации бактерий к высоким значениям солености и рН 30
2.5. Галофильныеи алкалофильные метилобактерий 35
Глава III. Материалы и методы 41
3.1. Объекты исследования 41
3.2. Выделение накопительных культур 41
3.3. Выделение чистых культур 42
3.4. Культивирование бактерий 42
3.5. Электронная микроскопия 43
3.6. Изучение культуральных и физиолого-биохимических свойств 43
3.7. Определение активности ферментов 45
3.8. Аналитические методы 51
3.8.1. Выделение и идентификация изопреноидных компонентов 51
3.8.2. Определение фосфолипидного состава 51
3.8.3 Определение состава жирных кислот 53
3.8.4. Выделение экзополисахаридов и определение мономериого состава 53
3.8.5. Н ЯМР-анализ осмоиротекторов 54
3.8.6. ТСХ метод определения содержания осмоиротекторов 54
3.8.7. ВЭЖХ метод определения содержания эктоина 55
3.8.8. Определение внутриклеточного объема 55
3.9. Молекулярпо-генетические методы и филогенетический анализ 56
3.9.1. Выделение и очистка препаратов ДИК 56
3.9.2. Определение нуклеотидного состава ДНК 57
3.9.3. ДНК-ДНК-гибридизация 57
3.9.4. ПЦР-амплификация гена 16SpPHK 58
3.9.5. ПЦР-амплификация гена ДАБ-аминотрансферазы (ect В) 59
3.9.6. Секвенирование ДНК и филогенетический анализ 59
Глава IV. Выделение и характеристика галофильных алкалофильиых и галофильных нейтрофильных метилобактерий 60
4.1. Выделение и характеристика галоалкалофильных метилобактерий из содовых озер ..60
4.2. Выделение и характеристика галоалкалофильных метилотрофов из разрушающегося мрамора 66
4.3. Выделение и характеристика галофильных нейтрофильных метилобактерий с водорослей Красного моря 70
Глава V. Особенности метаболизма галоалкалофильных и галофильных нейтрофильных метилобактерий 73
Глава VI. Филогенетическое и таксономическое положение новых изолятов 75
Глава VII. Осмоадаптация представителей рода Methylophaga 78
7.1. Состав фосфолипидов и жирных кислот клеток в зависимости от солености среды...78
7.2. Осмопротекторы 79
Глава VIII. Обсуждение 84
Заключение 95
Выводы 97
Литература 98
