Введение
Глава 1. Обзор литературы 12
1.1. Микроорганизмы-деструкторы полициклических ароматических углеводородов 14
1.2. Метаболические пути деструкции нафталина и фенантрена 16
1.2.1. Биохимические пути утилизации нафталина микроорганизмами 17
1.2.2. Метаболические пути разложения фенантрена бактериями 25
1.3. Генетические системы биодеградации ПАУ 31
1.3.1. Структурно-функциональная организация генетических систем деградации нафталинау бактерий 31
1.3.2. Генетические системы биодеградации фенантрена 35
1.4. Галофильные микроорганизмы 38
1.4.1. Микробная деструкция углеводородов в условиях повышенного содержанияNaCl 38
1.4.2. Механизмы галоадаптации у микроорганизмов 41
Глава 2. Материалы и методы 46
2.1. Бактериальные штаммы 46
2.2. Среды и условия культивирования 46
2.3. Накопительные культуры 48
2.4. Определение ростовых характеристик 49
2.5. Таксономическая характеристика микроорганизмов 49
2.6. Выделение и рестрикция плазмидной ДНК 53
2.7. Коньюгационный перенос плазмидной ДНК 56
2.8. Элиминация бактериальных плазмид 56
2.9. Определение стабильности признаков биодеградации ПАУ 57
2.10. Определение активностей ферментов биодеградации ПАУ 57
2.11. Анализ метаболитов ПАУ методом тонкослойной хроматографии 58
2.12. Скрининг бактериальных культур методом отпечатков 59
2.13. Статистическая обработка 59
Глава 3. Результаты исследований и их обсуждение 60
3.1. Образцы почвы, донных отложений и их характеристика 60
3.2. Выделение и характеристика штаммов-деструкторов нафталина, фенантрена, бифенила 63
3.2.1. Выделение штаммов-деструкторов ПАУ 63
3.2.2. Идентификация штаммов-деструкторов ПАУ 64
3.2.3. Характеристика деградативных способностей штаммов-деструкторов нафталина и фенантрена 70
3.2.4. Влияние повышенных концентраций хлорида натрия на рост бактерий-деструкторов ПАУ 80
3.2.5. Роль плазмид в деградации ПАУ и устойчивости бактерий к повышенным концентрациям NaCl 91
3.3. Накопительные культуры микроорганизмов 97
3.3.1. Характеристика накопительных культур, инкубированных на полноценных средах с различным содержанием хлорида натрия 97
3.3.2. Характеристика накопительных культур микроорганизмов, инкубированных на минеральной среде Раймонда с нафталином при повышенных концентрациях хлорида натрия 100
3.3.3. Микробное сообщество, осуществляющее деструкцию нафталина при повышенных концентрациях NaCl 104
Заключение 110
Выводы 115
Список литературы 117
