Введение
1. Обзор литературы: биоразнообразие и применение молекулярно-генетических методов для его изучения 12
1.1. Определение понятия «биоразнообразие» 12
1.2. Разнообразие видов. криптические виды 13
1.2.1. Симпатрические криптические виды 14
1.2.2. Аллопатрические виды и виды-космополиты 15
1.2.3. Закономерности возникновения криптических видов 20
1.3. Внутривидовой генетический полиморфизм 22
1.4 Молекулярно-генетические методы, применяемые для изучения биоразнообразия 26
1.4.1 История применения молекулярно-генетических методов для изучения биоразнообразия 26
1.4.2. ДНК-штрихкодирование 29
1.4.4. Митохондриальные псевдогены 36
1.4.5. Митохондриальная интрогрессия 38
1.4.6. Ядерные гены, используемые в качестве генетических маркеров для рутинного молекулярного анализа 41
1.5.Изучение биоразнообразия арктики с применением молекулярно-генетических методов 46
2. Материалы и методы 48
2.1. Сбор материала и создание спиртовой коллекции 48
2.2. Выделение ДНК 48
2.3. Амплификация целевого фрагмента с помощью полимеразнои цепной реакции (ПЦР) 51
3. Результаты 55
3.1. Получение данных о последовательностях фрагментов генов сої, гистона 3 и транскрибируемого спейсера its ряда морских беспозвоночных кандалакшского залива 55
3.2 Анализ полученных последовательностей ядерных и митохондриальных маркеров. низкий внутривидовой полиморфизм изученных видов беспозновночных кандалакшского залива 56
3.3. Результаты анализа полученных последовательностей 57
3.3.1. Catablema vesicarium (Cnidaria, Hydrozoa, Panndeidae) 57
3.3.2. Cyanea capillata (Cnidaria, Scyphozoa) 57
3.3.3. Arenicola marina Annelida, Polychaeta, Arenicolidae) 60
3.3.4. Brada inhabilis (Rathke, 1843) (Annelida, Polychaeta, Flabelligeridae) 61
3.3.5. Eteone longa (Annelida, Polychaeta, Phyllodocidae) 62
3.3.6. Flabelligera affinis (Annelida, Polychaeta, Flabelligeridae) 64
3.3.7. Harmothoe imbricata (Annelida, Polychaeta, Polynoidae) 65
3.3.8. Lumbrineris fragilis (O.F. Miiller, 1776) (Annelida, Polychaeta, Lumbrineridae) 66
3.3.9 Marenzelleria arctica (Annelida, Polychaeta, Spionidae) 69
3.3.10. Micronephtys minuta (Theel, 1879) и Micronephtys neotena (Noyes, 1980) (Annelida, Polychaeta, Nephtyidae) 70
3.3.11. Owenia fusiformis (Annelida, Polychaeta, Oweniidae) и другие виды-карлики 71
3.3.12. Polycirrus medusa (Annelida, Polychaeta, Terebellidae) 73
3.3.13. Pygospio elegans Claparede, 1863, (Annelida, Polychaeta, Spionidae)... 74
3.3.14. Комплекс видов Scoloplos armiger (Annelida, Polychaeta, Orbiniidae). 75
3.3.15. Terebellides stroemi (Annelida, Polychaeta, Terebellidae) 80
3.3.16. Ophiopholis aculeate (Echinodermata, Ophiuroidea, Ophiactidae) 83
3.3.17. Psolusphantapus (Echinodermata, Holothuroidea) 84
3.3.18. Strongylocentrotuspallidus (Echinodermata, Echinoidea, Echinoida) 85
3.3.19. Dendronotus dalli = Dendronotus niveus (Mollusca, Gastropoda, Dendronotidae) 86
3.3.20. Nannopus palustris Brady, 1880 (Crustacea, Copepoda, Harpacticoid)... 88
3.4. Определение таксономического положения представителей класса tantulocarida (crustacea, maxillopoda) 92
4. Обсуждение результатов 95
4.1. Полученная база данных последовательностей фрагментов генов сої, гистона 3 и транскрибируемого спейсера its морских беспозвоночных кандалакшского залива белого моря 95
4.2. Сравнение результатов молекулярно-генетического анализа с морфологическими данным 97
4.2.1. Виды-двойники 98
4.2.2. Ошибки в таксономических определениях 101
4.3. Сравнение результатов анализа митохондриальных и ядерных маркеров 102
4.3.1. Различия между последовательностями СОЇ составляют 2% 103
4.3.2. Несовпадение топологий филогенетических деревьев, построенных по результатам анализа ядерных маркеров и маркеров митохондриальных (последовательности фрагментов НЗ и СОЇ) 104
4.4. Изучение полиморфизма ядерного генома 107
Заключение 110
Выводы 111
Список литературы
