Введение
Глава 1. Популяционно-генетические исследования возбудителя бурой ржавчины пшеницы в России и за рубежом (обзор литературы) 15
1.1 Биологические особенности Puccinia triticina 16
1.2 Исследования структуры Puccinia triticina по признаку вирулентности 18
1.3 Исследования структуры Puccinia triticina по изозимным спектрам 45
1.4 Исследования структуры популяций Puccinia triticina по ДНК-полиморфизму 45
Глава 2. Материал и методы исследований 58
2.1 Материал исследований 58
2.2 Методы изучения популяций Puccinia triticina 60
2.2.1 Анализ вирулентности 60
2.2.2 Анализ ДНК полиморфизма популяций Puccinia triticina 63
2.2.2.1 RAPD-анализ 63
2.2.2.2 Анализ полиморфизма микросателлитных локусов 64
2.2.2.3 SNP-анализ (анализ олигонуклеотидного полиморфизма) 66
2.2.3 Статистическая обработка результатов популяционных исследований 68
2.3. Изучение влияния сортов пшеницы на изменчивость популяций Puccinia triticina
2.3.1 Фитопатологические методы оценки устойчивости пшеницы 70
2.4.2 Использование ДНК-маркеров для идентификации Lr-генов у сортов пшеницы 71
2.3.2.1 Подбор ПЦР маркера для идентификации гена LrAg 73
2.3.3 Мониторинг эффективности устойчивости TcLr-линий в условиях Северо-Запада 76
Глава 3. Структура популяций возбудителя бурой ржавчины на мягкой пшенице в России по фенотипическому составу 77
3.1 Динамика фенотипического состава Рuccinia triticina в центрально-европейских регионах России 78
3.2 Динамика фенотипического состава Рuccinia triticina в Поволжье 83
3.3 Динамика фенотипического состава Рuccinia triticina в Северокавказском регионе 90
3.4 Динамика фенотипического состава Рuccinia triticina в западноазиатских регионах РФ 94
3.5 Динамика фенотипического состава Рuccinia triticina в России в 2001-2017 гг 99
Глава 4. Структура популяций возбудителя бурой ржавчины на мягкой пшенице по ДНК полиморфизму 106
4.1 Исследования Рuccinia triticina по RAPD и УП ПЦР полиморфизмам 106
4.2 Полиморфизм популяций Рuccinia triticina по микросателлитным маркерам 118
Глава 5. Молекулярно-генетическая структура популяций Puccinia triticina на видах пшеницы и эгилопсов 126
5.1 Полиморфизм Рuccinia triticina на видах Triticum и Aegilops по вирулентности 126
5.2 Полиморфизм Рuccinia triticina на видах Triticum и Aegilops по микросателлитным локусам .128
5.3 Полиморфизм дагестанских изолятов Рuccinia triticina, выделенных с видов родичей, по SNP-маркерам 150
Глава 6. Генетическое разнообразие российских сортов мягкой пшеницы по устойчивости к возбудителю бурой ржавчины 156
6.1 Характеристика сортов, включенных в Государственной реестр селекционных достижений, по устойчивости к возбудителю бурой ржавчины 156
6.2. Генетическое разнообразие сортов пшеницы, рекомендуемых для выращивания в РФ 159
6.3 Молекулярные подходы в идентификации генов устойчивости к бурой ржавчине 168
Глава 7. Влияние выращиваемых сортов пшеницы на изменчивость структуры популяций Рuccinia triticina по вирулентности 179
7.1 Динамика вирулентности Puccinia triticina в европейской части России 179
7.2 Динамика вирулентности Puccinia triticina в Поволжье 183
7.3 Динамика вирулентности Puccinia triticina в Северокавказском регионе 184
7.3.1 Многолетние исследования дагестанской популяции 187
7.4 Динамика вирулентности Puccinia triticina в Уральском регионе 192
7.5 Динамика вирулентности Puccinia triticina в Западно-Сибирском регионе 193
7.6 Динамика вирулентности Puccinia triticina в регионах РФ в 2001-2017
гг 199
7.7 Мониторинг эффективности Lr-генов в полевых условиях Северо Запада 208
Глава 8. Характеристика микроэволюционных процессов в российских популяциях Рuccinia triticina (заключение) 212
Выводы 224
Список литературы 227
Список сокращений 277
Приложение А 278
Приложение Б 284
Приложение В 304
