Введение
Глава 1. Обзор научной литературы 12
1.1. Краткий обзор истории формирования населения Крыма 13
1.2. Динамика численности изученных популяций в XIX-XXI вв. 15
1.3. Лингвистическое разнообразие популяций Крыма 19
1.4. Антропологический облик народов Крыма 20
1.5. Использование однородительских и полногеномных генетических маркеров в популяционной генетике человека 22
1.6. Изученность генофонда Крыма по однородительским и полногеномным генетическим маркерам 27
Глава 2. Материалы и методы 32
2.1. Источники и объем использованных материалов 32
2.2. Методы экспериментального анализа ДНК 37
2.3. Методы статистического анализа 39
2.4. Методы картографического анализа 39
2.5. Методы филогенетического анализа 39
2.6. Методы биоинформатического анализа 39
Глава 3. Структура генофонда коренного населения Крыма по данным трех генетических систем 40
3.1. Структура генофонда Крыма по маркерам Y-хромосомы 40
3.2. Разнообразие линий мтДНК в популяциях крымских татар и греков 52
3.3. Характеристика коренных народов Крыма по полногеномным данным 56
3.4. Сходные закономерности в результатах анализа по трем системам маркеров 63
Глава 4. Геногеография основных компонентов крымского генофонда 65
4.1. Вклад восточно-средиземноморских миграций 66
4.2. Вклад переднеазиатских миграций 68
4.3. Следы миграций населения из степной полосы Евразии 70
4.4. Возможный генетический вклад иных популяций 72
Глава 5. Характеристика предковых популяций коренного населения Крыма методом ADMIXTURE 75
5.1. Выявление оптимальных параметров анализа методом ADMIXTURE и особенности интерпретации 75
5.2. Структура генофонда изученных популяций при семи вероятных предковых группах 80
5.3. Степень согласованности результатов анализа ADMIXTURE с другими полученными данными 82
Глава 6. Формирование генофонда коренного населения Крыма по данным генетики и других наук 85
6.1. Крымские татары в контексте других популяций с этнонимом «татары» (волго-уральских и сибирских татар) 85
6.2. Модели формирования генофонда коренного населения Крыма 92
Выводы 102
Литература 103
Благодарности 128
