Введение
ГЛАВА 1. CLASS Обзор литератур CLASS ы 13
1.1. Внутривидовое типирование патогенных микроорганизмов на основе фенотипических признаков
1.2. Использование молекулярно-генетических методов для внутри-видового типирования возбудителей бактериальных инфекций
1.3. Дифференциация штаммов патогенных буркхольдерий с использованием молекулярно-биологических методов
Собственные исследования 42
Глава 2. Материалы и методы 42
2.1. Штаммы микроорганизмов, питательные среды, условия культивирования
2.2. Подготовка проб для ПЦР 45
2.3. Выделение ДНК 45
2.4. Полимеразная цепная реакция 46
2.4.1. Реакция амплификации с произвольными праймерами 46
2.4.2. Реакция амплификации со специфическими праймерами 47
2.4.3. Реакция амплификации для мультилокусного сиквенс-типирования
2.5. Детекция продуктов амплификации и определение размеров фрагментов ДНК
2.6. Секвенирование продуктов амплификации и анализ полученных нуклеотидных последовательностей
2.7. Статистическая обработка результатов 51
2.8. Заражение лабораторных животных 52
ГЛАВА 3. Генетическое типирование штаммов патогенных буркхольдерий с использованием сек-венирования
3.1. Монолокусное типирование штаммов патогенных буркхольдерий с использованием секвенирования флагеллярного и рибосо-мальных генов
3.2. Мультилокусное сиквенс-типирование штаммов патогенных буркхольдерий.
ГЛАВА 4. Генотипирование штаммов патогенных буркхольдерий на основе амплификации с произвольными праймерами (RAPD)
4.1. Стандартизация условий постановки реакции амплификации и подбор праймеров для RAPD-типирования патогенных буркхольде-рий . 69
4.2. Анализ генетического полиморфизма возбудителя сапа с использованием произвольных праймеров. 72
4.3. RAPD-типирование штаммов возбудителя мелиоидоза 78
4.4. RAPD-типирование мутантных и выделенных от экспериментально зараженных животных штаммов возбудителей сапа и мелиоидоза.
Заключение 89
Выводы 98
Список использованных источников 100
